More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3183 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
380 aa  722    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  65.7 
 
 
392 aa  444  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 
404 aa  135  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  31.39 
 
 
415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  31.13 
 
 
415 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  31.81 
 
 
408 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  27.35 
 
 
408 aa  123  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  30.08 
 
 
425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  25.89 
 
 
408 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  22.96 
 
 
402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0892  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 
408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  27.27 
 
 
407 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  22.42 
 
 
406 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  21.65 
 
 
404 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  24.23 
 
 
399 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  22.16 
 
 
414 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  22.16 
 
 
404 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  22.42 
 
 
404 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  22.16 
 
 
404 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2202  major facilitator transporter  27.15 
 
 
410 aa  99.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  23.66 
 
 
409 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6840  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 
384 aa  97.8  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.806913  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  28.46 
 
 
424 aa  96.3  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  28.49 
 
 
411 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2812  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 
427 aa  92.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2806  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 
434 aa  90.5  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0852  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 
438 aa  87  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.207548 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2858  major facilitator transporter  28.26 
 
 
423 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  27.57 
 
 
430 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2995  major facilitator transporter  28.12 
 
 
425 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4191  major facilitator transporter  27.22 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  25.19 
 
 
430 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  26.9 
 
 
430 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2336  major facilitator transporter  30.1 
 
 
427 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2950  major facilitator transporter  30.1 
 
 
427 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  26.9 
 
 
430 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2625  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2943  major facilitator transporter  27.37 
 
 
417 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2971  major facilitator transporter  29.98 
 
 
427 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
400 aa  76.3  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1896  major facilitator transporter  27.57 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1962  major facilitator superfamily transporter  27.57 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  24.63 
 
 
435 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1916  major facilitator transporter  27.57 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181905  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  26.65 
 
 
430 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  26.65 
 
 
430 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  25.4 
 
 
439 aa  74.3  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5945  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 
363 aa  73.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309927  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2715  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.82 
 
 
429 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.618209 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  25.73 
 
 
429 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  25.97 
 
 
433 aa  70.9  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13009  integral membrane protein  26.01 
 
 
445 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.64265e-25  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  27.25 
 
 
426 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  35.8 
 
 
439 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  25.99 
 
 
429 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  26.74 
 
 
426 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  25 
 
 
441 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  24.69 
 
 
463 aa  66.6  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  25.39 
 
 
428 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  35.19 
 
 
439 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 
434 aa  66.2  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  29.53 
 
 
398 aa  66.2  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  24.8 
 
 
441 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  26.77 
 
 
436 aa  66.2  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  23.32 
 
 
467 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  25.06 
 
 
424 aa  66.2  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  22.3 
 
 
450 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  22.3 
 
 
450 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  35.19 
 
 
439 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  24.74 
 
 
480 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  21.87 
 
 
451 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 
417 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  22.3 
 
 
450 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  22.3 
 
 
450 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  22.3 
 
 
450 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  22.3 
 
 
440 aa  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  35.19 
 
 
439 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  22.3 
 
 
450 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  22.3 
 
 
450 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  24.35 
 
 
427 aa  64.7  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  22.3 
 
 
450 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  28.72 
 
 
419 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  27.59 
 
 
394 aa  63.9  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 
400 aa  63.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1001  MFS family transporter  28.57 
 
 
419 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  22.3 
 
 
452 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  35.54 
 
 
439 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  22.3 
 
 
452 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3179  major facilitator transporter  23.7 
 
 
432 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107398  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  22.3 
 
 
452 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  22.3 
 
 
452 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  35.54 
 
 
439 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  25.14 
 
 
432 aa  63.5  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  25.62 
 
 
423 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  25.62 
 
 
423 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  24.25 
 
 
448 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  23.73 
 
 
432 aa  63.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  23.73 
 
 
432 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  27.53 
 
 
432 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.823594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>