More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3939 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 407 aa  786    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  53.48 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  51.4 
 
 		 400 aa  382  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3717  major facilitator superfamily MFS_1  51.04 
 
 		 394 aa  363  3e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  48.48 
 
 		 400 aa  336  2.9999999999999997e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3635  major facilitator superfamily MFS_1  45.89 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2430  major facilitator superfamily MFS_1  51.29 
 
 		 398 aa  316  5e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0189  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 		 390 aa  109  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2022  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 414 aa  104  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 390 aa  102  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 390 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1899  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 387 aa  96.3  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 390 aa  93.6  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3902  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 		 386 aa  92.8  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.088151  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0450  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.122733  normal  0.430828 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 407 aa  82.8  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 429 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 432 aa  80.5  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1616  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8624  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.860223  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  23.77 
 
 		 468 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2445  putative multidrug resistance protein  25.1 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  32.42 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  23.99 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0928  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 452 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.554921  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0319  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 430 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2370  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  27.23 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  23.73 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  24.54 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  25.4 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3046  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0751407 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0170  major facilitator superfamily MFS_1  34.84 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  23.47 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 460 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  24.18 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  22.16 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  29.39 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  22.02 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  23.64 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  22.37 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  23.64 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.65 
 
 		 460 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  32.81 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1015  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.449105 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2673  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  22.93 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  26.12 
 
 		 478 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3710  major facilitator superfamily MFS_1  23.45 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.010262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  25.83 
 
 		 413 aa  57  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 435 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 456 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 420 aa  57  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  23.4 
 
 		 428 aa  57  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  24.59 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 472 aa  56.6  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 		 460 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00358  permease  23.62 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>