More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0582 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 432 aa  849    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  45.82 
 
 		 407 aa  346  4e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0574  major facilitator family transporter  32.1 
 
 		 415 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84757 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0569  major facilitator family transporter  32.1 
 
 		 415 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.676652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0628  major facilitator family transporter  32.1 
 
 		 415 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0567  major facilitator family transporter  31.85 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  28.57 
 
 		 448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 419 aa  107  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 427 aa  107  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  25.69 
 
 		 450 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  25.69 
 
 		 450 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  25.69 
 
 		 450 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  25.69 
 
 		 450 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  25.69 
 
 		 450 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  25.69 
 
 		 450 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  24.59 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  25.69 
 
 		 450 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 423 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 423 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  25.46 
 
 		 450 aa  103  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  26.92 
 
 		 463 aa  102  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 442 aa  103  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  26.25 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  26.25 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  26.25 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  26.25 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  26.14 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  26.25 
 
 		 452 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 430 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  26.77 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  26.25 
 
 		 440 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 426 aa  100  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 431 aa  100  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  24.67 
 
 		 450 aa  99.8  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  26.53 
 
 		 458 aa  99.8  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  24.6 
 
 		 450 aa  99.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 428 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  24.67 
 
 		 450 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 435 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  26.16 
 
 		 454 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 449 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 439 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  26.22 
 
 		 461 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  25.36 
 
 		 427 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 417 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2612  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 433 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209857  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 452 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3034  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 432 aa  97.4  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.201695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  26.11 
 
 		 436 aa  97.1  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 449 aa  96.7  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 409 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 437 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  26 
 
 		 453 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  26 
 
 		 453 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 453 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  26.05 
 
 		 454 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  26 
 
 		 461 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 454 aa  94.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  26 
 
 		 453 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  26 
 
 		 453 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0299  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 442 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  26.05 
 
 		 454 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 443 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3398  d-galactonate transporter  26.2 
 
 		 458 aa  94.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 453 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 453 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 429 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 453 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0807  d-galactonate transporter  25.18 
 
 		 450 aa  94  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 439 aa  93.6  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 439 aa  93.6  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 455 aa  93.2  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 439 aa  93.2  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  27.1 
 
 		 450 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  27.02 
 
 		 450 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  27.04 
 
 		 454 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  25.29 
 
 		 447 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  24.94 
 
 		 450 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4450  d-galactonate transporter  24.94 
 
 		 450 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.13 
 
 		 437 aa  91.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 429 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 439 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 439 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  25.77 
 
 		 445 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4084  probable glucarate transporter  25.3 
 
 		 436 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.463281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  26.12 
 
 		 485 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6596  d-galactonate transporter  26.24 
 
 		 457 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  26.81 
 
 		 454 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3916  probable glucarate transporter  25.3 
 
 		 436 aa  90.5  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  26.16 
 
 		 485 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3978  putative glucarate transporter  25.3 
 
 		 436 aa  90.5  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.776069 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4023  glucarate transporter  25.3 
 
 		 436 aa  90.5  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.957782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  26.81 
 
 		 454 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3044  D-galactonate transporter  25 
 
 		 464 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>