More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1015 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0928  major facilitator transporter  76.55 
 
 
452 aa  685    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.554921  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1015  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
479 aa  937    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.449105 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0877  major facilitator superfamily MFS_1  34.43 
 
 
458 aa  249  9e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein, putative  38.73 
 
 
482 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3033  major facilitator family transporter  38.33 
 
 
483 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1266  MFS family transporter  38.33 
 
 
476 aa  212  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1264  major facilitator superfamily MFS_1  33.63 
 
 
466 aa  206  6e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0388  major facilitator transporter  33.18 
 
 
466 aa  200  6e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00816882  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0277  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 
594 aa  187  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491572  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7238  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 
474 aa  174  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  29.38 
 
 
465 aa  139  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  29.38 
 
 
465 aa  139  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.51 
 
 
478 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.85 
 
 
478 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.85 
 
 
484 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  27.06 
 
 
492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.75 
 
 
502 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  27.79 
 
 
465 aa  127  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  26.47 
 
 
461 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.73 
 
 
528 aa  123  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  30.82 
 
 
494 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0059  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 
478 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.976428  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.65 
 
 
469 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.29 
 
 
478 aa  121  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0921  major facilitator transporter  30.96 
 
 
455 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224208  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.71 
 
 
520 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.52 
 
 
474 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.7 
 
 
458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  27.35 
 
 
530 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.12 
 
 
509 aa  117  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.73 
 
 
534 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.7 
 
 
461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.71 
 
 
474 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.43 
 
 
477 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.28 
 
 
512 aa  114  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.89 
 
 
514 aa  114  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  31.44 
 
 
523 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.3 
 
 
532 aa  113  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2926  major facilitator transporter  27.09 
 
 
516 aa  113  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102472  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.32 
 
 
489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  30.43 
 
 
481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.68 
 
 
477 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2510  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  28.71 
 
 
510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.2 
 
 
524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1149  major facilitator transporter  32.16 
 
 
460 aa  111  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.48 
 
 
522 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1289  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.61 
 
 
529 aa  111  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.433628  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  24.89 
 
 
453 aa  111  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.71 
 
 
522 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.92 
 
 
482 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.34 
 
 
527 aa  110  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.52 
 
 
508 aa  110  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.83 
 
 
524 aa  109  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2475  major facilitator transporter  31.17 
 
 
468 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.39 
 
 
478 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 
480 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0268  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.17 
 
 
500 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0312698  decreased coverage  0.00157172 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 
457 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.23 
 
 
511 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.54 
 
 
487 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.14 
 
 
485 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4898  putative transport protein  30.84 
 
 
489 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00331224  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.71 
 
 
763 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.09 
 
 
452 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  29.41 
 
 
476 aa  107  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  27.38 
 
 
474 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.42 
 
 
569 aa  107  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01490  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.07 
 
 
624 aa  106  8e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.4 
 
 
501 aa  106  8e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  28.95 
 
 
476 aa  106  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.56 
 
 
471 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6917  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.17 
 
 
463 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5489  major facilitator transporter  30.75 
 
 
486 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157895 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3574  major facilitator transporter  30.75 
 
 
514 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0256  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.24 
 
 
522 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.27 
 
 
486 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.27 
 
 
486 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4793  major facilitator transporter  30.75 
 
 
514 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.27 
 
 
486 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.01 
 
 
475 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.27 
 
 
486 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4798  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.3 
 
 
518 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.27 
 
 
486 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.27 
 
 
486 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.37 
 
 
499 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  31 
 
 
479 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7319  major facilitator transporter  25.5 
 
 
452 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  29.22 
 
 
497 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  29.21 
 
 
468 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  29.21 
 
 
468 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.2 
 
 
480 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  29 
 
 
498 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1058  major facilitator transporter  28.19 
 
 
471 aa  104  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.111803  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2609  major facilitator transporter  25.42 
 
 
516 aa  104  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.35 
 
 
534 aa  104  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.29 
 
 
534 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  29.55 
 
 
480 aa  104  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.73 
 
 
478 aa  103  6e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 
497 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>