More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0189 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0189  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
390 aa  743    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2022  major facilitator superfamily MFS_1  64.77 
 
 
414 aa  463  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  60.57 
 
 
391 aa  442  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  58.21 
 
 
390 aa  419  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  55.9 
 
 
390 aa  411  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  57.69 
 
 
390 aa  411  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  57.03 
 
 
394 aa  368  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  49.6 
 
 
390 aa  316  4e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  34.2 
 
 
400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 
400 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 
407 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3635  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 
441 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3717  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 
394 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2430  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 
398 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 
409 aa  96.3  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1616  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 
406 aa  93.6  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0319  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 
409 aa  90.1  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0450  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 
412 aa  82  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.122733  normal  0.430828 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32250  Major facilitator family transporter protein  25.25 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 
443 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0834  major facilitator transporter  25.41 
 
 
433 aa  70.5  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  27.67 
 
 
419 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  26.98 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  26.55 
 
 
428 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0222  glycerol-3-phosphate transporter  25.21 
 
 
445 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.493626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0222  glycerol-3-phosphate transporter  25.21 
 
 
445 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  27.56 
 
 
448 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  25.57 
 
 
440 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 
407 aa  67  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  25.84 
 
 
440 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  25.84 
 
 
440 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  25.54 
 
 
413 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  25.53 
 
 
416 aa  66.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  23.47 
 
 
432 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  28.81 
 
 
430 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3292  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
439 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 
420 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  25.9 
 
 
420 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  24.52 
 
 
448 aa  64.3  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  25 
 
 
421 aa  63.5  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  29.28 
 
 
893 aa  63.5  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  25 
 
 
422 aa  63.5  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2622  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 
421 aa  63.2  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3949  major facilitator transporter  26.06 
 
 
417 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5303  major facilitator transporter  26.83 
 
 
436 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  26.05 
 
 
435 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  27.24 
 
 
912 aa  63.2  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3614  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
439 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 
415 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  25.9 
 
 
420 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  24.5 
 
 
432 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5727  major facilitator transporter  25.62 
 
 
434 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0029  regulatory protein UhpC  25.11 
 
 
442 aa  62.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3468  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 
395 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2484  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 
437 aa  62  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4252  regulatory protein UhpC  25.11 
 
 
439 aa  62  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  25.9 
 
 
420 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  25.9 
 
 
420 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4069  regulatory protein UhpC  24.57 
 
 
442 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3902  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 
386 aa  61.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.088151  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  23.97 
 
 
456 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 
443 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  25.53 
 
 
434 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4014  regulatory protein UhpC  24.57 
 
 
442 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  26.71 
 
 
917 aa  60.8  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1001  MFS family transporter  26.26 
 
 
419 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  25.67 
 
 
439 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  26.49 
 
 
441 aa  60.5  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0032  regulatory protein UhpC  25.11 
 
 
439 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  28.67 
 
 
431 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 
430 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03551  membrane protein regulates uhpT expression  25.11 
 
 
439 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0036  phosphoglycerate transporter  25.11 
 
 
439 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3880  regulatory protein UhpC  25.11 
 
 
439 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  26.92 
 
 
410 aa  60.1  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5097  regulatory protein UhpC  25.11 
 
 
439 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.113676 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4119  regulatory protein UhpC  24.14 
 
 
442 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3998  regulatory protein UhpC  24.14 
 
 
442 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03493  hypothetical protein  25.11 
 
 
439 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4177  regulatory protein UhpC  24.14 
 
 
442 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 
423 aa  60.1  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4032  regulatory protein UhpC  25.11 
 
 
439 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.47751 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  28.28 
 
 
431 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  21.17 
 
 
418 aa  59.7  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5109  phosphoglycerate transporter family protein  24.16 
 
 
444 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4940  glycerol-3-phosphate transporter  23.9 
 
 
444 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  27.32 
 
 
450 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5500  phosphoglycerate transporter family protein  24.16 
 
 
444 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4496  major facilitator transporter  26.73 
 
 
434 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5132  major facilitator transporter  26.07 
 
 
412 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  26.28 
 
 
442 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  25.54 
 
 
428 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5429  phosphoglycerate transporter family protein  23.96 
 
 
444 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 
431 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5920  major facilitator transporter  26.65 
 
 
435 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0977977  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0137  major facilitator transporter  22.34 
 
 
427 aa  58.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711872  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  25.54 
 
 
428 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  24.87 
 
 
432 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>