More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5303 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3143  major facilitator transporter  83.94 
 
 
433 aa  703    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4496  major facilitator transporter  84.72 
 
 
434 aa  711    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3147  major facilitator transporter  85.88 
 
 
434 aa  728    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5303  major facilitator transporter  100 
 
 
436 aa  847    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5132  major facilitator transporter  84.3 
 
 
412 aa  666    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5002  major facilitator transporter  85.08 
 
 
433 aa  701    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5727  major facilitator transporter  84.62 
 
 
434 aa  695    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  64.58 
 
 
413 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  66.58 
 
 
419 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1001  MFS family transporter  65.62 
 
 
419 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32250  Major facilitator family transporter protein  54.17 
 
 
415 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2622  major facilitator superfamily MFS_1  43.69 
 
 
421 aa  335  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  40.34 
 
 
425 aa  291  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  42.18 
 
 
410 aa  286  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5618  major facilitator transporter  33.25 
 
 
428 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.287687 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  35.18 
 
 
420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6076  major facilitator transporter  32.11 
 
 
416 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4090  major facilitator transporter  31.34 
 
 
417 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.116905  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4739  major facilitator transporter  31.34 
 
 
426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178474  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3427  major facilitator transporter  31.34 
 
 
462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5210  major facilitator transporter  32.05 
 
 
416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.925158  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3372  major facilitator transporter  32.2 
 
 
416 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2742  major facilitator transporter  30.55 
 
 
418 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 
425 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  27.78 
 
 
439 aa  103  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0477  major facilitator transporter  28.71 
 
 
441 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  29.61 
 
 
455 aa  101  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  25.32 
 
 
417 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  25.73 
 
 
456 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  26.46 
 
 
429 aa  94  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 
427 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 
429 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  25.6 
 
 
428 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  26.67 
 
 
431 aa  91.3  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  25 
 
 
460 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  25.26 
 
 
436 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.23 
 
 
437 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 
407 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 
426 aa  87.8  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  27.41 
 
 
444 aa  87.8  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 
437 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  30.66 
 
 
430 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  28.89 
 
 
415 aa  87.4  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 
451 aa  86.7  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  27.57 
 
 
423 aa  87  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0045  d-galactonate transporter  24.57 
 
 
430 aa  86.7  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  27.57 
 
 
423 aa  87  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  28.47 
 
 
435 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  31.25 
 
 
430 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  26.29 
 
 
428 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1678  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.251673 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2772  major facilitator transporter  28.04 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243448  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  32.72 
 
 
429 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 
460 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  27.63 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  25.89 
 
 
430 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 
451 aa  84  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 
416 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  26.06 
 
 
428 aa  84  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  26.06 
 
 
428 aa  84  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  26.06 
 
 
428 aa  84  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  27.72 
 
 
427 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  28.83 
 
 
426 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  28.83 
 
 
426 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  28.29 
 
 
436 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  26.06 
 
 
428 aa  83.2  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  29.06 
 
 
426 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 
417 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  27.51 
 
 
417 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 
417 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 
417 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  27.38 
 
 
415 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 
417 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 
420 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  27.71 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  25.5 
 
 
434 aa  82  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  25.37 
 
 
453 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  27.27 
 
 
425 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  26.18 
 
 
441 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2672  major facilitator transporter  27.03 
 
 
433 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529284  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  27.5 
 
 
436 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  27.5 
 
 
436 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  24.32 
 
 
446 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  27.5 
 
 
436 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  26.09 
 
 
446 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  28.74 
 
 
430 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  27.16 
 
 
423 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  25.41 
 
 
430 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  25.41 
 
 
430 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.88 
 
 
460 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  26.09 
 
 
458 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  25.45 
 
 
429 aa  80.5  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2344  major facilitator transporter  29.73 
 
 
449 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  27.9 
 
 
435 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  27.15 
 
 
428 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  25.73 
 
 
441 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  24.55 
 
 
430 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  25.73 
 
 
458 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 
433 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>