More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0609 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 420 aa  821    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5618  major facilitator transporter  37.66 
 
 		 428 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.287687 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6076  major facilitator transporter  37.79 
 
 		 416 aa  236  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4739  major facilitator transporter  37.06 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178474  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4090  major facilitator transporter  37.06 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.116905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3427  major facilitator transporter  37.06 
 
 		 462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3372  major facilitator transporter  38.05 
 
 		 416 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5210  major facilitator transporter  37.79 
 
 		 416 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.925158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2742  major facilitator transporter  37.28 
 
 		 418 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  35.71 
 
 		 413 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3147  major facilitator transporter  34.24 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5727  major facilitator transporter  34.4 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5303  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 436 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4496  major facilitator transporter  34.64 
 
 		 434 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3143  major facilitator transporter  35.18 
 
 		 433 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5002  major facilitator transporter  34.98 
 
 		 433 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5132  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 419 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1001  MFS family transporter  33.92 
 
 		 419 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32250  Major facilitator family transporter protein  29.93 
 
 		 415 aa  157  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2622  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 421 aa  153  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 425 aa  152  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 412 aa  102  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  29.35 
 
 		 398 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 415 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 428 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 440 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 440 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 430 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 439 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 426 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 439 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 439 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 415 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 439 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 415 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 426 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 426 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  28.88 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 439 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 415 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 432 aa  87.8  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 430 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 430 aa  87  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  28.16 
 
 		 400 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 435 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 432 aa  86.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 415 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 415 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  26.25 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  26.25 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  26.25 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  26.25 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  26.25 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  24.38 
 
 		 418 aa  86.3  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  26.25 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 431 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3710  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.010262 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4045  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 421 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  26.14 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  25.98 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  27 
 
 		 439 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  28.26 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  25.53 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5470  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 451 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5392  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0128328 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>