More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3372 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2742  major facilitator transporter  93.75 
 
 		 418 aa  710    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4090  major facilitator transporter  94.23 
 
 		 417 aa  717    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.116905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3372  major facilitator transporter  100 
 
 		 416 aa  806    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4739  major facilitator transporter  94.61 
 
 		 426 aa  705    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178474  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5210  major facilitator transporter  98.08 
 
 		 416 aa  791    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.925158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6076  major facilitator transporter  93.25 
 
 		 416 aa  734    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3427  major facilitator transporter  93.98 
 
 		 462 aa  713    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5618  major facilitator transporter  78.92 
 
 		 428 aa  623  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.287687 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  38.05 
 
 		 420 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  34.98 
 
 		 413 aa  216  8e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4496  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3147  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 434 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5727  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3143  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5132  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 412 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1001  MFS family transporter  34.82 
 
 		 419 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 425 aa  187  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5002  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 433 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2622  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 		 421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32250  Major facilitator family transporter protein  28.61 
 
 		 415 aa  179  7e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5303  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 436 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 410 aa  176  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 		 407 aa  95.5  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2187  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 440 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 430 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 443 aa  88.2  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 415 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 415 aa  86.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 491 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  28.62 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  28.62 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  26.92 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2527  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.730064  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  25.14 
 
 		 436 aa  80.5  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 413 aa  80.1  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 436 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1232  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8624  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.860223  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1173  MFS short chain dicaboxylate:H+ symporter DcaK  24.43 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.603793  normal  0.341481 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  27.89 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  27.84 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  28 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 456 aa  77  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  27.21 
 
 		 400 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  24.09 
 
 		 404 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 432 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3710  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.010262 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  27.98 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1553  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1882  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0481298  normal  0.608146 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 451 aa  73.2  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 436 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 850 aa  72.8  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0884  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  25 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002192  putative MFS transporter  25.31 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0137434  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 		 427 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>