More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2187 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2187  major facilitator transporter  100 
 
 		 440 aa  880    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1257  major facilitator transporter  66.27 
 
 		 462 aa  563  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.375741  hitchhiker  0.00856521 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1697  major facilitator transporter  33.89 
 
 		 462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 		 432 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  23.79 
 
 		 451 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5618  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.287687 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  21.53 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  24.64 
 
 		 448 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  23.19 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0477  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4878  major facilitator transporter  25 
 
 		 426 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 		 449 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  22.42 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  25.24 
 
 		 454 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6033  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0486241  normal  0.0413157 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  23.6 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4700  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.164238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5470  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5392  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0128328 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8624  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 		 461 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.860223  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  23.24 
 
 		 454 aa  73.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 446 aa  73.2  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6076  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  26 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4739  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178474  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3427  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 462 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1173  MFS short chain dicaboxylate:H+ symporter DcaK  22.65 
 
 		 421 aa  72  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.603793  normal  0.341481 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  22.89 
 
 		 447 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  24.07 
 
 		 436 aa  72.4  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 455 aa  72  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  21.51 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  22.09 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  20.92 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  25 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  22.77 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4090  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.116905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  22.82 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  25.42 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1232  major facilitator transporter  21.93 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  23.59 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  25.75 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3372  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01360  carboxylic acid transport protein, putative  22.71 
 
 		 542 aa  68.2  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00179855  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 459 aa  68.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  22.91 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  21.59 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  24.08 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2742  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 491 aa  67.8  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  24.92 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  24.92 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  24.92 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  25.75 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 432 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  23.46 
 
 		 427 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3147  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 434 aa  67  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  24.5 
 
 		 433 aa  67  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  22.77 
 
 		 439 aa  67  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  21.14 
 
 		 450 aa  66.6  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  22.77 
 
 		 439 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  22.77 
 
 		 439 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  21.43 
 
 		 450 aa  66.6  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  24.32 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 454 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  23.4 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  26.47 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5692  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419889  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  23.41 
 
 		 449 aa  65.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  23.4 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36120  putative MFS transporter  23.24 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263423 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  23.38 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  23.4 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5210  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.925158  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>