More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3250 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  100 
 
 		 433 aa  842    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  44.83 
 
 		 438 aa  301  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  45.32 
 
 		 430 aa  296  5e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  41.97 
 
 		 448 aa  296  6e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  40.69 
 
 		 453 aa  283  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 444 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  40.15 
 
 		 506 aa  280  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  43.7 
 
 		 405 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  40.7 
 
 		 440 aa  277  3e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  41.56 
 
 		 438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  40.35 
 
 		 438 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  43.15 
 
 		 442 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  39.1 
 
 		 441 aa  260  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 418 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 449 aa  219  7.999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 465 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  51.15 
 
 		 578 aa  212  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  35.4 
 
 		 465 aa  210  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  34.9 
 
 		 467 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  33.82 
 
 		 475 aa  209  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 467 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  34.59 
 
 		 470 aa  207  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  34.16 
 
 		 440 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 433 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 424 aa  192  9e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  32.5 
 
 		 461 aa  192  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 437 aa  190  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  35.83 
 
 		 426 aa  186  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  49.07 
 
 		 542 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  32.75 
 
 		 424 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 443 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 443 aa  178  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  37.81 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  33.84 
 
 		 457 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  33.84 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 		 435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 		 440 aa  173  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 454 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  45.58 
 
 		 530 aa  168  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 416 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  35.09 
 
 		 413 aa  163  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 456 aa  163  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  45.22 
 
 		 536 aa  162  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 451 aa  160  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 		 471 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 478 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 413 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 		 413 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 441 aa  152  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 461 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 416 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 472 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 452 aa  144  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 464 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  43.59 
 
 		 198 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 418 aa  141  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 426 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 426 aa  140  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 453 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  32.13 
 
 		 426 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 		 426 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 464 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 427 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 427 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 461 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 461 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 490 aa  131  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 453 aa  130  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 533 aa  129  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 443 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 440 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 442 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 442 aa  123  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 447 aa  123  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  30.5 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  30.5 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  30.56 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  30.5 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  30.5 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  30.5 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 454 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 457 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 450 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  32.42 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>