More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4429 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  100 
 
 		 453 aa  899    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  69.37 
 
 		 471 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  64.14 
 
 		 461 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 433 aa  230  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 472 aa  229  8e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 442 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 446 aa  220  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 459 aa  212  9e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  36.45 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 468 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  32.19 
 
 		 475 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 465 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 465 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 470 aa  202  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 437 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 467 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 467 aa  200  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  32.25 
 
 		 464 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 454 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 444 aa  192  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 451 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 443 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 440 aa  190  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 461 aa  189  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 450 aa  187  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 490 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 443 aa  179  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  31.87 
 
 		 457 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  31.87 
 
 		 457 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 453 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 438 aa  173  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  34.72 
 
 		 472 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 464 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 		 478 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 449 aa  163  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 457 aa  160  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 454 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 461 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 433 aa  150  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 441 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 405 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 443 aa  147  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  29.53 
 
 		 440 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 506 aa  143  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  32.42 
 
 		 426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 433 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  39.73 
 
 		 542 aa  141  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 461 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 578 aa  138  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 430 aa  137  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 453 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  41.08 
 
 		 536 aa  133  7.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 457 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 451 aa  127  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  32 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 447 aa  126  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  28.91 
 
 		 424 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 448 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 460 aa  122  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 424 aa  120  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 530 aa  118  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 448 aa  116  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 438 aa  116  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 450 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 450 aa  114  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0685  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 413 aa  110  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1677  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  29.64 
 
 		 449 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 413 aa  104  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  39.52 
 
 		 198 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 416 aa  103  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  31.56 
 
 		 479 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 442 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  35.78 
 
 		 533 aa  98.6  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 441 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  31.72 
 
 		 471 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 442 aa  97.4  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0795  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 484 aa  97.4  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 432 aa  96.7  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 442 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 		 426 aa  96.3  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 427 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 427 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0505  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 449 aa  95.9  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 426 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 416 aa  95.5  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  29.23 
 
 		 426 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0585  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 449 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.0455182 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  28.52 
 
 		 422 aa  93.6  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 467 aa  93.2  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 423 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>