More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5791 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  100 
 
 		 454 aa  889    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 443 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  37.22 
 
 		 457 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  37.22 
 
 		 457 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 470 aa  229  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 467 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  34.96 
 
 		 468 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 467 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 465 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 465 aa  221  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  33.73 
 
 		 475 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 433 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  32.64 
 
 		 472 aa  209  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 457 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  36.82 
 
 		 478 aa  208  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  33.75 
 
 		 440 aa  206  9e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 454 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 461 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 490 aa  187  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 450 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 450 aa  182  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 437 aa  179  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 464 aa  177  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 464 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 443 aa  172  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 441 aa  170  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 456 aa  161  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 451 aa  160  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  31.83 
 
 		 446 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1677  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 459 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 461 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 444 aa  148  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 426 aa  146  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 472 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  28.51 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  40.95 
 
 		 542 aa  140  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 430 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 438 aa  137  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 457 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 405 aa  133  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 453 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 443 aa  133  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 453 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 438 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 461 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 578 aa  124  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 453 aa  124  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  34.5 
 
 		 449 aa  120  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 448 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 461 aa  117  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 		 471 aa  117  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 433 aa  116  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 530 aa  116  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 536 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  38.89 
 
 		 448 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  34.82 
 
 		 438 aa  113  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0795  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 484 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 447 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 442 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 506 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 460 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 418 aa  106  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 		 447 aa  106  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0505  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  27.78 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 450 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  28.62 
 
 		 426 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  39.86 
 
 		 198 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 426 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 533 aa  101  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 424 aa  100  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  27.52 
 
 		 449 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 426 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 442 aa  99  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  28.96 
 
 		 479 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 440 aa  96.7  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  27.25 
 
 		 449 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 431 aa  94.7  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  28.83 
 
 		 471 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 437 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  27.15 
 
 		 427 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 452 aa  92.8  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  26.84 
 
 		 446 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 446 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 427 aa  91.3  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 427 aa  91.3  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 432 aa  90.5  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 450 aa  90.1  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 413 aa  89.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 405 aa  87.4  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 439 aa  87.8  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  26.97 
 
 		 424 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 413 aa  86.7  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>