More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4014 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  100 
 
 		 438 aa  862    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  75 
 
 		 442 aa  575  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  62.12 
 
 		 448 aa  506  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  45.27 
 
 		 433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  39.01 
 
 		 438 aa  263  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  39.74 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 506 aa  242  7.999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  40.47 
 
 		 418 aa  236  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 444 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 441 aa  232  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 438 aa  231  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  36.01 
 
 		 440 aa  230  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  35.95 
 
 		 453 aa  230  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 430 aa  228  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  36.55 
 
 		 449 aa  197  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 578 aa  193  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  33 
 
 		 465 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  31.63 
 
 		 440 aa  189  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  33 
 
 		 468 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 461 aa  186  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 467 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 465 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 467 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 470 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 443 aa  180  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 426 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 472 aa  176  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  32.62 
 
 		 443 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  32.18 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  32.03 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  32.61 
 
 		 424 aa  170  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 433 aa  169  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 440 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 424 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  31.2 
 
 		 475 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 454 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 435 aa  150  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 437 aa  149  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 		 478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 443 aa  146  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  41.4 
 
 		 542 aa  146  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  39.59 
 
 		 536 aa  145  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 413 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 440 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 530 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 450 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 464 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 416 aa  134  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 461 aa  133  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 451 aa  133  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 441 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  30.24 
 
 		 464 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  42.57 
 
 		 198 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 413 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 451 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  30 
 
 		 426 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 426 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 457 aa  123  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  33.92 
 
 		 471 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 461 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 416 aa  121  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 418 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 454 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 448 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  27.36 
 
 		 448 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3842  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 472 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 452 aa  113  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  30.26 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  30.26 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  30.26 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  30.26 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  30.26 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  30 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 442 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 850 aa  110  5e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 441 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 453 aa  110  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 442 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>