More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0585 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  100 
 
 		 542 aa  1050    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  49.71 
 
 		 530 aa  438  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  46.46 
 
 		 536 aa  405  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  36.61 
 
 		 533 aa  268  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  50.23 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  47.3 
 
 		 472 aa  187  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  48.83 
 
 		 456 aa  186  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 506 aa  186  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  47.26 
 
 		 465 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  46.77 
 
 		 468 aa  183  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  46.27 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  45.5 
 
 		 461 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  47.8 
 
 		 444 aa  182  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  45.27 
 
 		 467 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  30.77 
 
 		 475 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  46.27 
 
 		 470 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  49.07 
 
 		 433 aa  181  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  44.78 
 
 		 467 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  45.83 
 
 		 443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  43.98 
 
 		 440 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  44.68 
 
 		 457 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  49.07 
 
 		 438 aa  173  6.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  44.68 
 
 		 457 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  44.59 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  47.22 
 
 		 453 aa  172  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  30.74 
 
 		 578 aa  170  6e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  42.42 
 
 		 440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  44.84 
 
 		 450 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  49.76 
 
 		 430 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  47.45 
 
 		 440 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  45.73 
 
 		 441 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 437 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  41.85 
 
 		 440 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  41.9 
 
 		 478 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  43.5 
 
 		 443 aa  151  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  44.79 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  47.37 
 
 		 405 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  42.31 
 
 		 438 aa  146  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 443 aa  145  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  44.95 
 
 		 451 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  45.97 
 
 		 418 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  39 
 
 		 448 aa  140  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  40.95 
 
 		 454 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  41.4 
 
 		 438 aa  136  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  42.45 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 472 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  38.14 
 
 		 457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  36 
 
 		 457 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  37.27 
 
 		 461 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  38.38 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 442 aa  126  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 461 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  42.77 
 
 		 198 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  39.73 
 
 		 453 aa  121  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 		 426 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 		 426 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  37.5 
 
 		 449 aa  117  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  36.92 
 
 		 426 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  40.22 
 
 		 442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  38.53 
 
 		 464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 450 aa  115  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 459 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  39.13 
 
 		 450 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  36.65 
 
 		 453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 451 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  38.92 
 
 		 479 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  36.77 
 
 		 471 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  40.91 
 
 		 427 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  36.68 
 
 		 454 aa  113  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  40.91 
 
 		 427 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  30.1 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  41.05 
 
 		 432 aa  110  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  33.63 
 
 		 446 aa  110  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 448 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  35.75 
 
 		 850 aa  109  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  40.82 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 413 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1677  major facilitator transporter  40.97 
 
 		 444 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  35.75 
 
 		 413 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  34.23 
 
 		 461 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 435 aa  104  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 423 aa  103  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 		 447 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  36.95 
 
 		 447 aa  101  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  27.88 
 
 		 448 aa  100  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  45.83 
 
 		 460 aa  100  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 422 aa  99  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  35.5 
 
 		 452 aa  98.2  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 464 aa  96.3  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  35.2 
 
 		 405 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  38.31 
 
 		 416 aa  95.5  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3842  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 420 aa  95.1  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 442 aa  94  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>