More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5424 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  100 
 
 		 198 aa  398  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  42.68 
 
 		 444 aa  141  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  44.58 
 
 		 426 aa  139  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  45.95 
 
 		 433 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  46.79 
 
 		 438 aa  137  8.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  44.81 
 
 		 440 aa  136  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  46.75 
 
 		 438 aa  136  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  45.39 
 
 		 453 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  44.16 
 
 		 443 aa  132  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  42.21 
 
 		 506 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  44.59 
 
 		 405 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  42.77 
 
 		 542 aa  122  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  38.99 
 
 		 449 aa  122  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  41.51 
 
 		 448 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  41.51 
 
 		 578 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  45.81 
 
 		 430 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  38.22 
 
 		 461 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  40.44 
 
 		 467 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  45 
 
 		 478 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  40.44 
 
 		 465 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  39.71 
 
 		 470 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  40.65 
 
 		 461 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  40.88 
 
 		 438 aa  115  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  39.71 
 
 		 465 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  39.71 
 
 		 468 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  39.71 
 
 		 467 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  44.96 
 
 		 441 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  43.28 
 
 		 440 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 536 aa  112  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  43.09 
 
 		 472 aa  112  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 443 aa  111  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  46.96 
 
 		 450 aa  111  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  42.36 
 
 		 530 aa  110  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 441 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  39.13 
 
 		 454 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  41.91 
 
 		 440 aa  109  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  44.35 
 
 		 451 aa  108  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  41.61 
 
 		 433 aa  107  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  40.25 
 
 		 442 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  42.55 
 
 		 432 aa  106  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  36.76 
 
 		 475 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  37.8 
 
 		 424 aa  105  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  39.73 
 
 		 472 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 418 aa  105  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  40.6 
 
 		 533 aa  104  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  40.44 
 
 		 440 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  41.03 
 
 		 471 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  36.59 
 
 		 424 aa  102  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 454 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  37.42 
 
 		 427 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  37.42 
 
 		 427 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  41.55 
 
 		 449 aa  101  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  41.03 
 
 		 461 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  40.15 
 
 		 456 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 437 aa  99  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  38.62 
 
 		 443 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  36 
 
 		 453 aa  98.2  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 		 435 aa  98.2  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  35.46 
 
 		 451 aa  97.4  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 457 aa  97.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  45.13 
 
 		 479 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  45.13 
 
 		 471 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  44.35 
 
 		 442 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 459 aa  96.3  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  42.59 
 
 		 460 aa  94  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 447 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  43.7 
 
 		 448 aa  93.2  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  38.76 
 
 		 457 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  38.76 
 
 		 457 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 447 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  39.52 
 
 		 453 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  33.55 
 
 		 423 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 450 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0795  major facilitator transporter  34.52 
 
 		 484 aa  90.5  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5920  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 435 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0977977  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  33.13 
 
 		 433 aa  88.6  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  36.77 
 
 		 426 aa  87.8  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  36.99 
 
 		 413 aa  87.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  36.99 
 
 		 413 aa  87.8  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  36.77 
 
 		 426 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  36.77 
 
 		 426 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 434 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 416 aa  85.1  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 457 aa  85.1  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  33.93 
 
 		 478 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  33.93 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.42 
 
 		 437 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 437 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 452 aa  82.4  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  34.64 
 
 		 452 aa  82  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  37.69 
 
 		 426 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 		 405 aa  82  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 418 aa  81.6  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2612  major facilitator transporter  33.12 
 
 		 433 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209857  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 450 aa  81.3  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  33.93 
 
 		 436 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 443 aa  81.3  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  36.15 
 
 		 440 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.94 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>