More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0360 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  100 
 
 
578 aa  1125    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  60 
 
 
438 aa  243  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  64.32 
 
 
405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  55.16 
 
 
418 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  49.56 
 
 
440 aa  209  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  51.63 
 
 
441 aa  206  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  51.15 
 
 
433 aa  205  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  46.38 
 
 
444 aa  194  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  51.89 
 
 
449 aa  189  9e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  48.06 
 
 
438 aa  188  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  48.87 
 
 
453 aa  188  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  51.81 
 
 
430 aa  186  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  47.85 
 
 
506 aa  183  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  35.71 
 
 
438 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  48.26 
 
 
448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  44.98 
 
 
536 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  43.72 
 
 
442 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  34.3 
 
 
443 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  34.09 
 
 
467 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  33.33 
 
 
470 aa  157  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  33.77 
 
 
465 aa  156  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  33.77 
 
 
467 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  33.44 
 
 
468 aa  153  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  33.12 
 
 
465 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  36.17 
 
 
461 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  41.2 
 
 
530 aa  150  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  40.31 
 
 
440 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  36 
 
 
461 aa  147  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  41.36 
 
 
542 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  38.16 
 
 
471 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  34.11 
 
 
475 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  34.04 
 
 
437 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  39.15 
 
 
426 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  39.81 
 
 
472 aa  142  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  38.46 
 
 
433 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  49.44 
 
 
432 aa  134  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  35.59 
 
 
478 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  37.8 
 
 
456 aa  133  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  38.18 
 
 
454 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  33.79 
 
 
472 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  36.41 
 
 
440 aa  130  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  33.89 
 
 
443 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  32.99 
 
 
450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  40.7 
 
 
441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  27.05 
 
 
533 aa  128  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  35.75 
 
 
457 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  35.75 
 
 
457 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  32.91 
 
 
451 aa  125  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  35.81 
 
 
451 aa  124  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  36.49 
 
 
453 aa  124  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  36.22 
 
 
454 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  34.67 
 
 
424 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  38.69 
 
 
440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  41.51 
 
 
198 aa  120  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  35.48 
 
 
443 aa  117  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  36.52 
 
 
413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  36.55 
 
 
424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  34.95 
 
 
453 aa  115  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  36.92 
 
 
457 aa  115  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  32.63 
 
 
461 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  34.08 
 
 
471 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  39.47 
 
 
442 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  33.22 
 
 
413 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  29.45 
 
 
464 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  33.66 
 
 
446 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  36.41 
 
 
460 aa  109  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  33.75 
 
 
422 aa  108  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  38.92 
 
 
450 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  30.9 
 
 
479 aa  108  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  31.17 
 
 
490 aa  107  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 
413 aa  107  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  28.21 
 
 
464 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  40 
 
 
405 aa  105  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  35.94 
 
 
449 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  33.19 
 
 
436 aa  104  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  38.27 
 
 
426 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3842  major facilitator transporter  32.41 
 
 
420 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  38.02 
 
 
435 aa  102  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  32.16 
 
 
442 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 
426 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  27.46 
 
 
418 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 
850 aa  102  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 
426 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 
427 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 
427 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  31.78 
 
 
433 aa  97.4  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  29.25 
 
 
457 aa  96.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0505  major facilitator transporter  36.27 
 
 
449 aa  95.5  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  36.6 
 
 
452 aa  95.9  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  31.63 
 
 
454 aa  95.1  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 
405 aa  95.5  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  32.37 
 
 
436 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3254  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 
416 aa  94.4  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254674  normal  0.0467898 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2064  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 
410 aa  94  6e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000913971  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  30.23 
 
 
461 aa  94  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  29.86 
 
 
453 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  29.86 
 
 
453 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 
453 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0685  major facilitator transporter  32.69 
 
 
438 aa  93.6  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  29.86 
 
 
453 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>