More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2011 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  100 
 
 		 446 aa  853    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  52.15 
 
 		 454 aa  419  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  39.4 
 
 		 459 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  35.4 
 
 		 471 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 453 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  38.37 
 
 		 461 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 464 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 437 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 472 aa  189  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  34.77 
 
 		 454 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 470 aa  183  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 467 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  34.97 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  34.97 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 468 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 443 aa  180  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 464 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 465 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 490 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  29.54 
 
 		 475 aa  170  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  33.75 
 
 		 478 aa  162  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 454 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 450 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 461 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 441 aa  159  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 440 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 472 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  34.91 
 
 		 442 aa  153  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 451 aa  153  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 456 aa  152  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 457 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  35.04 
 
 		 426 aa  140  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 457 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 438 aa  133  6e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 443 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 453 aa  130  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 440 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 443 aa  127  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 433 aa  126  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 449 aa  124  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  29 
 
 		 444 aa  123  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  31.6 
 
 		 448 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 405 aa  120  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 461 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  28.52 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 448 aa  116  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  31.6 
 
 		 450 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 		 447 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  32.57 
 
 		 578 aa  113  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  33.63 
 
 		 542 aa  113  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 451 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 438 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 453 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 413 aa  107  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2369  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 447 aa  106  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 		 413 aa  106  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 536 aa  106  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  26.92 
 
 		 440 aa  106  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  30.14 
 
 		 449 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0585  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.0455182 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 438 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0505  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  30 
 
 		 479 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  31.58 
 
 		 471 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0685  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 438 aa  99.8  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  29.26 
 
 		 426 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 427 aa  97.8  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 427 aa  97.8  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 442 aa  96.3  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 850 aa  95.9  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 426 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 426 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 432 aa  95.1  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 435 aa  94  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 506 aa  93.6  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1677  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 444 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 416 aa  88.2  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 409 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 		 405 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 530 aa  84.3  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  27.41 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>