More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4329 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  100 
 
 		 457 aa  894    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  34.98 
 
 		 433 aa  243  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 461 aa  240  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  33.86 
 
 		 443 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  34.25 
 
 		 457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  34.25 
 
 		 457 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 464 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 470 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 465 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 468 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 465 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 467 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 467 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 440 aa  219  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  32.74 
 
 		 475 aa  213  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 464 aa  210  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 450 aa  209  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 454 aa  209  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 454 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 472 aa  206  7e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 443 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 456 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  32.4 
 
 		 490 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 440 aa  189  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 437 aa  186  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  31.42 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 		 478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 450 aa  176  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 461 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 451 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 447 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 444 aa  162  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 		 447 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  30 
 
 		 453 aa  156  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  28.6 
 
 		 454 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 438 aa  151  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 448 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 453 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 426 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 459 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 440 aa  142  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 471 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  39.18 
 
 		 433 aa  137  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 461 aa  137  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 472 aa  137  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0795  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 484 aa  136  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  33.46 
 
 		 449 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  30.15 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1677  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 446 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  36 
 
 		 542 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 441 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 438 aa  122  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0585  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 		 449 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.0455182 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 448 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 430 aa  119  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  36.61 
 
 		 536 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 450 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0505  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 449 aa  116  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  36.92 
 
 		 578 aa  115  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  35.08 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  29.64 
 
 		 479 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  29.19 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 442 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 461 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 530 aa  109  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 418 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 438 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 460 aa  104  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 424 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 434 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  26.06 
 
 		 424 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  37.16 
 
 		 198 aa  97.1  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 427 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 416 aa  95.9  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 427 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 405 aa  95.1  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 451 aa  92.4  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 423 aa  90.5  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 		 426 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 432 aa  89.7  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 418 aa  89  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  28.63 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 		 426 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 416 aa  87  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 442 aa  87  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 533 aa  83.2  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0685  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 438 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  25.11 
 
 		 448 aa  80.1  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 432 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>