More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3636 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  100 
 
 		 432 aa  830    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  37.6 
 
 		 433 aa  192  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  36.86 
 
 		 438 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 405 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 453 aa  178  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  34.9 
 
 		 442 aa  176  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 438 aa  171  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 418 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  33.59 
 
 		 440 aa  159  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 438 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 424 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 468 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 465 aa  156  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 472 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  33.15 
 
 		 424 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 467 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  46.76 
 
 		 578 aa  154  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 467 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 506 aa  152  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 465 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 470 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 		 426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  34.57 
 
 		 426 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 440 aa  146  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 443 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  36.53 
 
 		 426 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  31.47 
 
 		 457 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 448 aa  142  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 		 435 aa  142  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  31.22 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 478 aa  140  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 451 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 461 aa  136  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 441 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 440 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 451 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 454 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  29.46 
 
 		 475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  30 
 
 		 433 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 450 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 443 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 542 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 437 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 472 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  37 
 
 		 530 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 536 aa  120  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  32.32 
 
 		 479 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  39.87 
 
 		 198 aa  116  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 456 aa  116  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  31.99 
 
 		 471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  30.74 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 450 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  30 
 
 		 454 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 		 422 aa  113  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 434 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  39.6 
 
 		 533 aa  109  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 		 413 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2064  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000913971  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 442 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 443 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 452 aa  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 		 413 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 426 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  29.56 
 
 		 449 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 		 850 aa  104  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 457 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 471 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 448 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 427 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 407 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 427 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 490 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 459 aa  100  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 464 aa  99.8  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 		 405 aa  99.8  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 447 aa  99.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 413 aa  99  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 453 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 464 aa  97.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 416 aa  97.1  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 423 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 441 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 443 aa  94  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 440 aa  93.6  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  28.62 
 
 		 432 aa  92  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  27.38 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>