More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2760 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  100 
 
 
456 aa  884    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  56.16 
 
 
433 aa  455  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  42.66 
 
 
440 aa  349  5e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  44.17 
 
 
443 aa  344  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  41.55 
 
 
472 aa  323  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  41.74 
 
 
457 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  41.74 
 
 
457 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  40.18 
 
 
465 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  40.27 
 
 
468 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  39.96 
 
 
465 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  39.87 
 
 
467 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  40.09 
 
 
467 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  38.75 
 
 
470 aa  295  9e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  39.33 
 
 
475 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  38.67 
 
 
454 aa  276  6e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  37.24 
 
 
461 aa  274  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  38.39 
 
 
451 aa  274  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  37.25 
 
 
450 aa  263  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  36.62 
 
 
464 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  37.3 
 
 
464 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  38.74 
 
 
437 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  38.78 
 
 
441 aa  243  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  36.95 
 
 
472 aa  236  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  36.23 
 
 
443 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  33.97 
 
 
457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  34.66 
 
 
461 aa  216  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  34.6 
 
 
440 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  32.18 
 
 
490 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 
478 aa  206  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  34.58 
 
 
444 aa  201  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  35.52 
 
 
405 aa  199  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  34.23 
 
 
453 aa  199  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  32.73 
 
 
453 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 
471 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  31.76 
 
 
461 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  33.02 
 
 
450 aa  192  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  34.23 
 
 
433 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  48.83 
 
 
542 aa  186  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  32.77 
 
 
454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  34.79 
 
 
438 aa  184  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  33.86 
 
 
438 aa  183  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  33.97 
 
 
448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  31.34 
 
 
457 aa  179  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  43.6 
 
 
536 aa  168  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  31.74 
 
 
446 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  30.39 
 
 
449 aa  167  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  34.01 
 
 
448 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  46.61 
 
 
530 aa  163  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  31.47 
 
 
430 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  32.37 
 
 
447 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  36.64 
 
 
418 aa  159  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  30.82 
 
 
438 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  31.09 
 
 
453 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  33.09 
 
 
442 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  31.32 
 
 
506 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0795  major facilitator transporter  30.41 
 
 
484 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  31.22 
 
 
426 aa  150  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  31.68 
 
 
433 aa  150  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1677  major facilitator transporter  31.7 
 
 
444 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 
447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  29.18 
 
 
454 aa  146  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  30.62 
 
 
440 aa  146  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  27.06 
 
 
459 aa  146  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  28.74 
 
 
441 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 
413 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 
413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  27.98 
 
 
443 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  29.57 
 
 
413 aa  140  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0585  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 
449 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.0455182 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  26.17 
 
 
461 aa  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  28.22 
 
 
440 aa  137  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  33.17 
 
 
460 aa  136  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  37.8 
 
 
578 aa  133  6.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0685  major facilitator transporter  32.47 
 
 
438 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  29.93 
 
 
416 aa  128  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  27.82 
 
 
424 aa  128  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0505  major facilitator transporter  30.41 
 
 
449 aa  126  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  30.73 
 
 
442 aa  126  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  37.09 
 
 
533 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 
435 aa  123  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  31.92 
 
 
471 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  32.38 
 
 
449 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  31.6 
 
 
442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 
426 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  31.86 
 
 
450 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  30.13 
 
 
426 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 
426 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  28.34 
 
 
424 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  30.29 
 
 
479 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 
427 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 
427 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  27.12 
 
 
451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  27.2 
 
 
423 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  26.08 
 
 
405 aa  113  6e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2369  major facilitator transporter  28.5 
 
 
447 aa  107  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  30.29 
 
 
432 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  27.18 
 
 
418 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 
434 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  40.91 
 
 
198 aa  100  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  27.8 
 
 
410 aa  94.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>