More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02423 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  100 
 
 		 440 aa  870    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  71.8 
 
 		 441 aa  594  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  38.8 
 
 		 444 aa  291  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 430 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  43.47 
 
 		 506 aa  272  9e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  40.7 
 
 		 433 aa  271  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  39.91 
 
 		 453 aa  266  7e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 438 aa  246  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 449 aa  246  4.9999999999999997e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 438 aa  245  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  39.51 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  40.8 
 
 		 418 aa  236  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 438 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  35.63 
 
 		 448 aa  226  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 465 aa  216  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  36.11 
 
 		 468 aa  216  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  36.11 
 
 		 467 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  35.86 
 
 		 465 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 467 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 470 aa  210  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  49.56 
 
 		 578 aa  209  7e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  35.97 
 
 		 475 aa  206  7e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  34.24 
 
 		 442 aa  196  9e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 443 aa  193  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 440 aa  192  8e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  31.87 
 
 		 457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  31.87 
 
 		 457 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 426 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 443 aa  170  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 472 aa  170  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 437 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 454 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 542 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 443 aa  164  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 461 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 433 aa  159  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 440 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  41.82 
 
 		 530 aa  153  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  46.2 
 
 		 536 aa  152  8e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 440 aa  152  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  28.4 
 
 		 424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 457 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 478 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  29.54 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 413 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 454 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 471 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 441 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  33.23 
 
 		 442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 450 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 413 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 416 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 405 aa  140  4.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 457 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  31.07 
 
 		 449 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 432 aa  134  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  30.21 
 
 		 479 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 453 aa  131  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 427 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 427 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  28.03 
 
 		 471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 418 aa  127  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 461 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 464 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  29.03 
 
 		 426 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 461 aa  121  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 426 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 464 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  35 
 
 		 533 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 453 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  30.62 
 
 		 442 aa  113  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  43.28 
 
 		 198 aa  113  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 460 aa  112  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 450 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 448 aa  110  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 490 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 426 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 426 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  26.89 
 
 		 446 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 446 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 446 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 447 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 447 aa  99.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 447 aa  99.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 433 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 455 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 449 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 436 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>