More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0508 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  100 
 
 		 438 aa  863    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  45.57 
 
 		 444 aa  323  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  40.82 
 
 		 453 aa  312  5.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  42.58 
 
 		 430 aa  296  4e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  44.16 
 
 		 405 aa  295  9e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  41.81 
 
 		 449 aa  281  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 433 aa  276  4e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  39.31 
 
 		 506 aa  272  9e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  36.54 
 
 		 440 aa  250  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 441 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  37.95 
 
 		 438 aa  239  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 418 aa  232  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 448 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 438 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 440 aa  225  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 		 440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  35.4 
 
 		 472 aa  217  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 442 aa  216  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 465 aa  216  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  35.18 
 
 		 468 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 465 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 443 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 467 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 470 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  35.38 
 
 		 457 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  35.38 
 
 		 457 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  34.17 
 
 		 467 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 426 aa  199  7.999999999999999e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  32.01 
 
 		 475 aa  199  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 443 aa  193  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  32.4 
 
 		 424 aa  192  9e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  32.65 
 
 		 424 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  48.06 
 
 		 578 aa  188  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  38.96 
 
 		 450 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 437 aa  179  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 433 aa  177  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 405 aa  176  6e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 451 aa  176  7e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  49.07 
 
 		 542 aa  174  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  37.29 
 
 		 456 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 454 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 		 478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 434 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  31.39 
 
 		 413 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  34.9 
 
 		 442 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 454 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 		 471 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  47.93 
 
 		 530 aa  159  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 426 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  48.65 
 
 		 536 aa  159  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  32.98 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  35.74 
 
 		 472 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 453 aa  156  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  31.89 
 
 		 426 aa  156  8e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 457 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 447 aa  154  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 432 aa  153  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 451 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 440 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  32.27 
 
 		 471 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  31.69 
 
 		 479 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 442 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  31.56 
 
 		 449 aa  144  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  34.56 
 
 		 461 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  46.79 
 
 		 198 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 443 aa  137  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 426 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 426 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  32.4 
 
 		 454 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 457 aa  134  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 464 aa  133  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 440 aa  132  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 422 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 490 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 413 aa  126  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 427 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 427 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  30 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 405 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 448 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 459 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 441 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 460 aa  117  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0795  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 484 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>