More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3193 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
424 aa  822    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  88.21 
 
 
424 aa  736    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  35.23 
 
 
444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  35.24 
 
 
453 aa  213  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  36.18 
 
 
430 aa  211  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  37.27 
 
 
405 aa  209  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  34.86 
 
 
438 aa  200  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  32.65 
 
 
438 aa  193  6e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  32.93 
 
 
433 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  28.81 
 
 
461 aa  176  7e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  34.84 
 
 
418 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  33.25 
 
 
457 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  33.25 
 
 
457 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  32.33 
 
 
438 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  29.92 
 
 
506 aa  162  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  31.64 
 
 
443 aa  159  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  31.13 
 
 
449 aa  156  9e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  28.13 
 
 
440 aa  153  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  28.9 
 
 
448 aa  152  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  28.57 
 
 
443 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  31.55 
 
 
451 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 
435 aa  145  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 
426 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 
440 aa  142  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 
426 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  28.67 
 
 
441 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  29.82 
 
 
433 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  31.12 
 
 
426 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 
478 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  29.98 
 
 
442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  28.06 
 
 
472 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  29.44 
 
 
440 aa  132  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  29.31 
 
 
437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  33.15 
 
 
432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  28.68 
 
 
465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  28.43 
 
 
468 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  27.08 
 
 
450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  29.17 
 
 
467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  29.4 
 
 
461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  28.79 
 
 
470 aa  126  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  36.55 
 
 
578 aa  126  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  28.92 
 
 
467 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  28.68 
 
 
465 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  30.72 
 
 
450 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  32.99 
 
 
472 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  29.52 
 
 
449 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  28.69 
 
 
471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  29.38 
 
 
479 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  28.05 
 
 
461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  31.83 
 
 
416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  29.64 
 
 
442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 
471 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  29.34 
 
 
456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  27.68 
 
 
405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  29.25 
 
 
542 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  29.12 
 
 
426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  26.56 
 
 
475 aa  113  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  28.4 
 
 
441 aa  111  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  28.12 
 
 
454 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  37.8 
 
 
198 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  26.64 
 
 
457 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  28.86 
 
 
453 aa  103  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  25.52 
 
 
440 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  29.2 
 
 
448 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  30.61 
 
 
447 aa  100  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  33.33 
 
 
530 aa  100  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  24.41 
 
 
464 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 
422 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 
447 aa  99  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 
434 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  28.73 
 
 
416 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  25.43 
 
 
436 aa  98.2  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 
427 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  25.8 
 
 
423 aa  96.7  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  26.44 
 
 
453 aa  96.7  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 
427 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  34.57 
 
 
536 aa  97.1  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  24.49 
 
 
454 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  28.17 
 
 
413 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  24.29 
 
 
443 aa  93.2  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  27.33 
 
 
454 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  26.21 
 
 
451 aa  90.9  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  24.89 
 
 
490 aa  90.9  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  25.8 
 
 
427 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  26.67 
 
 
426 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  28.87 
 
 
442 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  26.41 
 
 
457 aa  88.2  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  25.66 
 
 
435 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  24.5 
 
 
459 aa  88.2  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  24.19 
 
 
464 aa  87.4  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  23.8 
 
 
418 aa  87.4  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 
413 aa  87  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  24.13 
 
 
449 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  25.63 
 
 
447 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  26.14 
 
 
461 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  26.9 
 
 
426 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  24.48 
 
 
453 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  25.13 
 
 
447 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  26.88 
 
 
440 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 
449 aa  84.7  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>