More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2014 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  100 
 
 		 459 aa  915    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 446 aa  276  6e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  38.71 
 
 		 454 aa  264  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 465 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 467 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  34.33 
 
 		 453 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 468 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 470 aa  192  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 467 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 465 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 		 471 aa  186  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  29.54 
 
 		 475 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 464 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 464 aa  179  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 472 aa  174  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 437 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 		 440 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 454 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 461 aa  166  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 490 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 441 aa  156  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  28.36 
 
 		 457 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  28.36 
 
 		 457 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 454 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 443 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  28.94 
 
 		 443 aa  151  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 472 aa  150  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 461 aa  149  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 457 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 450 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 444 aa  142  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 461 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 442 aa  134  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 456 aa  133  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 433 aa  131  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 457 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 440 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 450 aa  126  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 438 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 443 aa  122  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 453 aa  119  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 542 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 449 aa  110  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 438 aa  106  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 413 aa  106  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2369  major facilitator transporter  25.16 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 447 aa  103  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 442 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  25.93 
 
 		 449 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 447 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 441 aa  99.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 413 aa  97.4  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 438 aa  97.1  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 433 aa  97.1  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  30.63 
 
 		 440 aa  96.7  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1677  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 444 aa  96.7  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  31.85 
 
 		 198 aa  96.3  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 430 aa  96.3  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 426 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0795  major facilitator transporter  24.95 
 
 		 484 aa  93.6  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  30 
 
 		 536 aa  93.2  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 441 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0505  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 449 aa  92  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 426 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0585  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 449 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.0455182 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 448 aa  90.5  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 440 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 427 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 427 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 442 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 443 aa  88.2  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 578 aa  88.2  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  24.61 
 
 		 424 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 424 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 434 aa  86.7  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 533 aa  86.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 530 aa  86.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 506 aa  80.5  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  23.9 
 
 		 448 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  33.02 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  33.02 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  33.02 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>