More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1078 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  100 
 
 		 443 aa  876    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  80.18 
 
 		 457 aa  698    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  79.95 
 
 		 457 aa  697    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  45.56 
 
 		 472 aa  401  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  48.82 
 
 		 433 aa  378  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  47.07 
 
 		 440 aa  375  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  44.14 
 
 		 465 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  44.6 
 
 		 467 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  44.6 
 
 		 467 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  44.6 
 
 		 468 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  44.84 
 
 		 465 aa  335  9e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  43.43 
 
 		 470 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  45.09 
 
 		 456 aa  315  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  42.43 
 
 		 475 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  38.18 
 
 		 461 aa  291  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  38.37 
 
 		 478 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  40.56 
 
 		 437 aa  271  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  38.85 
 
 		 451 aa  270  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 443 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  40.83 
 
 		 472 aa  262  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  37.41 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  39.25 
 
 		 464 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 450 aa  256  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 490 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 441 aa  243  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  38.75 
 
 		 464 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 457 aa  239  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 454 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  37.41 
 
 		 461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 453 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  36.79 
 
 		 440 aa  223  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 444 aa  219  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  37.91 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 438 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  34.28 
 
 		 440 aa  199  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 430 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 461 aa  192  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 454 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 450 aa  190  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  37.21 
 
 		 433 aa  184  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 506 aa  183  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 441 aa  183  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 449 aa  182  9.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 446 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  32.62 
 
 		 438 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 453 aa  176  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 457 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  45.83 
 
 		 542 aa  175  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 453 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0795  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 484 aa  174  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 448 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 433 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  35.5 
 
 		 426 aa  169  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 471 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 418 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 443 aa  163  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 448 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  41.85 
 
 		 536 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 447 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  31.87 
 
 		 424 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  43.3 
 
 		 530 aa  156  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 416 aa  156  8e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 424 aa  155  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  33.17 
 
 		 426 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 426 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 		 426 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  38.63 
 
 		 450 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  31.77 
 
 		 447 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  36.48 
 
 		 449 aa  150  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 459 aa  149  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1677  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 444 aa  149  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 442 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 460 aa  147  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  35.76 
 
 		 479 aa  143  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  33.69 
 
 		 471 aa  143  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 440 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0585  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 		 449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.0455182 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0505  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 449 aa  136  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2369  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 447 aa  134  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 413 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 578 aa  130  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 427 aa  127  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 427 aa  127  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 533 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 442 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  30 
 
 		 416 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 432 aa  120  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0685  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 		 449 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 418 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>