280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2369 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2369  major facilitator transporter  100 
 
 
447 aa  872    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  32.78 
 
 
453 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0685  major facilitator transporter  32.09 
 
 
438 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  29.43 
 
 
475 aa  143  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  28.36 
 
 
465 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  28.36 
 
 
467 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  27.86 
 
 
467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  27.32 
 
 
468 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  27.61 
 
 
470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  27.07 
 
 
465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  29.57 
 
 
464 aa  127  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  30.02 
 
 
441 aa  127  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  27.43 
 
 
433 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  30.83 
 
 
437 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  28.64 
 
 
464 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  27.73 
 
 
443 aa  121  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  27.6 
 
 
490 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  29.27 
 
 
454 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  26.68 
 
 
451 aa  119  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  27.48 
 
 
450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  29.63 
 
 
454 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  27.41 
 
 
440 aa  116  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  25.28 
 
 
457 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  25.28 
 
 
457 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  25.11 
 
 
472 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 
478 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  30.33 
 
 
461 aa  107  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  27.82 
 
 
446 aa  107  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 
440 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  29.79 
 
 
444 aa  101  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  36.88 
 
 
438 aa  100  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  28.16 
 
 
426 aa  100  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  24.95 
 
 
459 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  27.75 
 
 
443 aa  98.2  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  30.56 
 
 
443 aa  96.3  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  27.06 
 
 
456 aa  96.3  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  30.94 
 
 
441 aa  95.5  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  28.06 
 
 
433 aa  94  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  27.79 
 
 
461 aa  93.6  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  26.53 
 
 
433 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  25.07 
 
 
430 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  26.7 
 
 
460 aa  90.9  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  26.75 
 
 
416 aa  90.5  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  30.14 
 
 
542 aa  89.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  26.38 
 
 
453 aa  89  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 
447 aa  89  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  26.29 
 
 
440 aa  89.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  28.61 
 
 
461 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  25.26 
 
 
506 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  24.86 
 
 
472 aa  87.8  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  30.08 
 
 
578 aa  86.7  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  27.44 
 
 
405 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  31.27 
 
 
418 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  24.21 
 
 
457 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  29.18 
 
 
447 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  24.83 
 
 
454 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  27.96 
 
 
448 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  27.8 
 
 
438 aa  82  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  35.06 
 
 
448 aa  82.4  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  28.61 
 
 
438 aa  82  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 
471 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  27.51 
 
 
440 aa  80.5  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  27.05 
 
 
461 aa  79  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  27.13 
 
 
449 aa  78.2  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  26.81 
 
 
413 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  25.52 
 
 
450 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  27.75 
 
 
530 aa  75.1  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  28.18 
 
 
536 aa  75.5  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  28.06 
 
 
416 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
413 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  25.93 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1677  major facilitator transporter  27.55 
 
 
444 aa  73.2  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  25.97 
 
 
451 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0505  major facilitator transporter  25.07 
 
 
449 aa  73.2  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  23.3 
 
 
426 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  24.85 
 
 
426 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  26.49 
 
 
457 aa  70.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  29.69 
 
 
533 aa  70.5  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  23 
 
 
447 aa  70.5  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  24.01 
 
 
443 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  25.95 
 
 
405 aa  69.3  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 
426 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  30.32 
 
 
448 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 
850 aa  67.8  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  26.24 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 
434 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  23.83 
 
 
435 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0585  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 
449 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.0455182 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  22.73 
 
 
441 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  32.6 
 
 
442 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  28.03 
 
 
409 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  25.19 
 
 
453 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  25.39 
 
 
441 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  23.2 
 
 
418 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  29.61 
 
 
423 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  26.77 
 
 
426 aa  63.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  27.92 
 
 
452 aa  62  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  29.8 
 
 
198 aa  62.4  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  25.74 
 
 
424 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>