More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5358 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  97.65 
 
 		 468 aa  882    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  95.29 
 
 		 467 aa  869    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  97.31 
 
 		 465 aa  858    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  80.35 
 
 		 475 aa  735    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  94.41 
 
 		 470 aa  839    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  100 
 
 		 465 aa  932    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  95.07 
 
 		 467 aa  867    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 437 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  43.98 
 
 		 472 aa  352  8e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  43.26 
 
 		 440 aa  346  5e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  44.14 
 
 		 443 aa  346  6e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 433 aa  330  3e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  42.66 
 
 		 457 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  42.66 
 
 		 457 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  40.78 
 
 		 461 aa  318  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  40.13 
 
 		 456 aa  291  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  36.96 
 
 		 454 aa  272  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  40.23 
 
 		 443 aa  268  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  37.02 
 
 		 464 aa  267  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 490 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 464 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  35.78 
 
 		 450 aa  256  8e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 		 478 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  36.95 
 
 		 440 aa  252  8.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 441 aa  241  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 451 aa  240  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 472 aa  233  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 457 aa  230  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 454 aa  230  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 444 aa  227  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 405 aa  220  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  35.86 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 453 aa  213  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 461 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 433 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  33.05 
 
 		 471 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 441 aa  204  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 430 aa  203  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  34.89 
 
 		 448 aa  200  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  33.03 
 
 		 457 aa  196  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 438 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  32.36 
 
 		 461 aa  187  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 459 aa  186  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  37.22 
 
 		 418 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  32.5 
 
 		 447 aa  184  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  47.26 
 
 		 542 aa  184  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 438 aa  183  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 426 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  32.16 
 
 		 449 aa  179  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 454 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 453 aa  177  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 		 447 aa  176  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 446 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 448 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  30.62 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 530 aa  172  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 460 aa  166  6.9999999999999995e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0795  major facilitator transporter  31 
 
 		 484 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 536 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 442 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 440 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 506 aa  162  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 443 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 461 aa  160  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 427 aa  156  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 427 aa  156  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  33.12 
 
 		 578 aa  152  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0505  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 449 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 435 aa  146  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1677  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 444 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 416 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 426 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 426 aa  140  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 442 aa  140  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  30.59 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0585  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 449 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.0455182 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  27.59 
 
 		 434 aa  133  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 432 aa  130  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2369  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 424 aa  128  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 413 aa  127  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 450 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  28.64 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 479 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  32.89 
 
 		 471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 442 aa  121  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  28.28 
 
 		 424 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  31.43 
 
 		 449 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>