More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2862 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  100 
 
 		 448 aa  894    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  62.12 
 
 		 438 aa  514  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  58.9 
 
 		 442 aa  463  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  42.4 
 
 		 433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  38.43 
 
 		 438 aa  265  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  40.84 
 
 		 405 aa  259  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 444 aa  248  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  36.82 
 
 		 440 aa  247  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  34.4 
 
 		 441 aa  244  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 453 aa  243  6e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 438 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 506 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  35.76 
 
 		 430 aa  228  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 418 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  34.9 
 
 		 449 aa  206  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  34.91 
 
 		 426 aa  190  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  48.26 
 
 		 578 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 468 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 465 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 465 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 472 aa  182  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 467 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 467 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 440 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  31.68 
 
 		 475 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 461 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 470 aa  177  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  33 
 
 		 443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 437 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  31.46 
 
 		 457 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  31.46 
 
 		 457 aa  170  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 440 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 416 aa  160  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 424 aa  159  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 443 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 454 aa  156  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  29.31 
 
 		 424 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 461 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  39 
 
 		 542 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 443 aa  151  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 440 aa  147  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 405 aa  143  7e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 456 aa  143  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 478 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 427 aa  141  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 435 aa  140  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 427 aa  141  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  27 
 
 		 451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 434 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 464 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  38.83 
 
 		 536 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  31.99 
 
 		 426 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 471 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  32.14 
 
 		 449 aa  133  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  39.32 
 
 		 530 aa  133  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 		 426 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 432 aa  132  9e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  31.12 
 
 		 479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  32.54 
 
 		 471 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 490 aa  130  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 450 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 451 aa  129  8.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 413 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 		 413 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  36.87 
 
 		 439 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 413 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 457 aa  127  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 448 aa  126  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  35.78 
 
 		 439 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 426 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 454 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 416 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 441 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 439 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 439 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 426 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 472 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  28.6 
 
 		 446 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 457 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 439 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  41.51 
 
 		 198 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  36.57 
 
 		 440 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 442 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 442 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 442 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  29.65 
 
 		 448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 436 aa  114  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>