More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3439 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  88.21 
 
 		 424 aa  700    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  100 
 
 		 424 aa  820    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  37.74 
 
 		 405 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 430 aa  204  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 453 aa  203  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  32.4 
 
 		 438 aa  188  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 438 aa  186  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  33.84 
 
 		 457 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 461 aa  166  9e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  33.84 
 
 		 457 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 506 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 438 aa  160  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 418 aa  160  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 449 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 443 aa  151  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  27.55 
 
 		 440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 		 435 aa  146  8.000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 426 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 448 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 426 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 441 aa  144  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  31.59 
 
 		 426 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 443 aa  143  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 472 aa  141  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 478 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 451 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 450 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 450 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 465 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 432 aa  127  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 470 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 440 aa  127  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 472 aa  126  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 437 aa  126  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 465 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 442 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  29.34 
 
 		 449 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  29.83 
 
 		 479 aa  124  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  28.86 
 
 		 471 aa  123  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 578 aa  123  7e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.96 
 
 		 475 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 461 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 426 aa  113  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 542 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 454 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 405 aa  109  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 461 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 448 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 464 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 416 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 457 aa  104  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 416 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 427 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 427 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  36.59 
 
 		 198 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 454 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 464 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  36.54 
 
 		 530 aa  100  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 454 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 453 aa  97.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 422 aa  96.3  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  24.13 
 
 		 436 aa  94.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 447 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 440 aa  94.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 413 aa  94.4  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 447 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 453 aa  94.4  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 443 aa  94  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 490 aa  93.2  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  25 
 
 		 418 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 536 aa  92.8  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 434 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  25.53 
 
 		 427 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 435 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 413 aa  87  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 447 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 436 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 451 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>