More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1023 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  100 
 
 		 448 aa  857    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  39.1 
 
 		 461 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  40.99 
 
 		 441 aa  264  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 468 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 465 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  34.4 
 
 		 465 aa  220  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 470 aa  219  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 467 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 467 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 472 aa  217  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  35.83 
 
 		 433 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  34.64 
 
 		 475 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 450 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  34.7 
 
 		 437 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  38.66 
 
 		 447 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 454 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  38.31 
 
 		 447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 443 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 456 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  35.68 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  35.68 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 472 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 440 aa  172  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 440 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 490 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0585  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 		 449 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.0455182 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 457 aa  161  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 464 aa  160  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 453 aa  156  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 443 aa  153  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 433 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 443 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 430 aa  142  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 461 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 454 aa  136  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 418 aa  133  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 		 435 aa  133  6.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 454 aa  133  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 449 aa  132  9e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 405 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 440 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 471 aa  131  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 448 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 426 aa  130  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 461 aa  128  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 438 aa  127  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 442 aa  124  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  27.77 
 
 		 453 aa  123  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 457 aa  123  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 413 aa  121  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  30.09 
 
 		 440 aa  120  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 438 aa  119  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 424 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 542 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 530 aa  117  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 450 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 506 aa  113  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 413 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 413 aa  110  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 453 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 460 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  28.8 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 426 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0505  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 449 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 536 aa  106  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 433 aa  104  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  28.92 
 
 		 449 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 426 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1677  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 444 aa  103  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  29.81 
 
 		 426 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 423 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  30.91 
 
 		 479 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 416 aa  98.6  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  30.94 
 
 		 471 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 405 aa  97.8  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 422 aa  97.8  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 438 aa  96.7  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 450 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 		 419 aa  94  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  43.7 
 
 		 198 aa  93.6  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2369  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 447 aa  93.6  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 578 aa  93.6  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 451 aa  93.2  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 416 aa  91.3  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  38.33 
 
 		 533 aa  90.1  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 432 aa  89.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0795  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 484 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>