More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0609 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  96.77 
 
 		 447 aa  659    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  100 
 
 		 447 aa  814    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0585  major facilitator superfamily MFS_1  82.16 
 
 		 449 aa  501  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.0455182 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  45.17 
 
 		 441 aa  300  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  37.33 
 
 		 461 aa  246  6e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 433 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 465 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 448 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 468 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 467 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 465 aa  206  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 467 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  32.54 
 
 		 475 aa  206  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 470 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  36.57 
 
 		 437 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 454 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 457 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 		 440 aa  183  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  33.5 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  33.5 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 472 aa  181  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  32.44 
 
 		 443 aa  179  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 490 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  35.63 
 
 		 443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 440 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 456 aa  172  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 464 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  31.26 
 
 		 478 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 451 aa  159  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 461 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 464 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 450 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 453 aa  137  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 405 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  30.97 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 453 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 472 aa  127  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 433 aa  126  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 438 aa  123  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 461 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 459 aa  120  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  32.62 
 
 		 424 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  29.44 
 
 		 440 aa  118  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 438 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 426 aa  110  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 424 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 461 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 542 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 418 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0505  major facilitator transporter  36.9 
 
 		 449 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 438 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 506 aa  100  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 405 aa  99.4  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 448 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 		 413 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 440 aa  97.4  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1677  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 444 aa  96.3  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 432 aa  95.9  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2369  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 447 aa  95.5  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 433 aa  95.5  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 442 aa  94.4  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 442 aa  94  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 416 aa  93.2  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 460 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  39.86 
 
 		 198 aa  91.3  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 441 aa  90.5  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 427 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 427 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 405 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 443 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  30.48 
 
 		 441 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  30.48 
 
 		 441 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  30.48 
 
 		 441 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  30.48 
 
 		 441 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  30.48 
 
 		 441 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0795  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 484 aa  88.2  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  34.52 
 
 		 536 aa  88.2  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  30.48 
 
 		 441 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  30.09 
 
 		 479 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 442 aa  87.4  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 439 aa  87.4  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>