More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5424 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 471 aa  924    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  69.37 
 
 		 453 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  63.89 
 
 		 461 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  39.18 
 
 		 442 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 472 aa  229  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  35.33 
 
 		 446 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 468 aa  213  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 433 aa  213  9e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 465 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 465 aa  209  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  34.69 
 
 		 475 aa  208  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 470 aa  205  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 467 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 467 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 461 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 456 aa  190  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 459 aa  189  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 444 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 437 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 454 aa  186  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 440 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  31.57 
 
 		 443 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 453 aa  178  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 443 aa  176  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 464 aa  176  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 440 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 450 aa  173  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 451 aa  171  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 490 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 454 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  29.34 
 
 		 457 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  29.34 
 
 		 457 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  31.64 
 
 		 438 aa  159  8e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 		 478 aa  159  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  31.24 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 440 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 441 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  32.82 
 
 		 472 aa  153  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 430 aa  153  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  32.64 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 443 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 405 aa  151  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 441 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 457 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  38.16 
 
 		 578 aa  147  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  34.77 
 
 		 438 aa  146  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  29.25 
 
 		 440 aa  144  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  42.58 
 
 		 542 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 461 aa  143  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  37.62 
 
 		 426 aa  143  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  41.62 
 
 		 536 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 506 aa  136  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 461 aa  136  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 453 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 451 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 448 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 454 aa  126  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  38.05 
 
 		 530 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 457 aa  124  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 424 aa  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 448 aa  123  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 438 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  40.76 
 
 		 460 aa  121  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  29.23 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 447 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 413 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0795  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 484 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 447 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  41.03 
 
 		 198 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  37.85 
 
 		 416 aa  103  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 442 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 434 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  37.09 
 
 		 533 aa  100  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  25.3 
 
 		 436 aa  100  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 450 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  33.33 
 
 		 449 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0505  major facilitator transporter  34.72 
 
 		 449 aa  98.2  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 435 aa  97.4  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 450 aa  96.7  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  27.92 
 
 		 441 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  25.49 
 
 		 453 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  25.49 
 
 		 453 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 453 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  27.78 
 
 		 441 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  27.78 
 
 		 441 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 452 aa  94.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  27.78 
 
 		 441 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  27.78 
 
 		 441 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 453 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  27.78 
 
 		 441 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 850 aa  94.4  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 441 aa  93.6  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  24.13 
 
 		 449 aa  93.2  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>