More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3077 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  100 
 
 		 441 aa  843    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  41.59 
 
 		 461 aa  295  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 447 aa  266  8e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  44.15 
 
 		 447 aa  259  6e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  37.04 
 
 		 467 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 465 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 468 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  36.79 
 
 		 467 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  38.78 
 
 		 457 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  38.78 
 
 		 457 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 465 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  37.29 
 
 		 443 aa  249  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  35.24 
 
 		 470 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 448 aa  247  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  35.21 
 
 		 472 aa  246  4.9999999999999997e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  35.08 
 
 		 475 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0585  major facilitator superfamily MFS_1  44.5 
 
 		 449 aa  243  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.0455182 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  37.36 
 
 		 437 aa  242  7.999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 		 440 aa  239  8e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  38.83 
 
 		 456 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  36.7 
 
 		 454 aa  227  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 450 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 451 aa  216  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 440 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 		 478 aa  212  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 464 aa  209  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  33.95 
 
 		 490 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 461 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 457 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 464 aa  193  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 472 aa  190  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 457 aa  179  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 454 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 426 aa  177  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 453 aa  170  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 446 aa  169  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 405 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  45.77 
 
 		 542 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 444 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 430 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 438 aa  159  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 459 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 454 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 438 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 461 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 		 471 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 453 aa  152  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 453 aa  151  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  29.5 
 
 		 440 aa  150  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 440 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 506 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  40.58 
 
 		 536 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 450 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 413 aa  139  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 449 aa  138  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 438 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  37.87 
 
 		 530 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  31 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  40.8 
 
 		 578 aa  132  9e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2369  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 447 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  30.37 
 
 		 426 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  30.12 
 
 		 426 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  33 
 
 		 442 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 442 aa  127  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 416 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 533 aa  123  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  35.02 
 
 		 450 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  33.44 
 
 		 449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1677  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 444 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 432 aa  121  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 460 aa  120  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 416 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  32.47 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  33.44 
 
 		 479 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  44.96 
 
 		 198 aa  113  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0505  major facilitator transporter  40.88 
 
 		 449 aa  113  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 443 aa  111  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 424 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 451 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 432 aa  106  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 447 aa  106  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>