More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3455 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  100 
 
 		 430 aa  856    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 444 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  46.28 
 
 		 453 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  45.32 
 
 		 433 aa  322  8e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 506 aa  312  9e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  43.47 
 
 		 440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  40.9 
 
 		 441 aa  307  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  41.47 
 
 		 405 aa  269  8e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  41.86 
 
 		 418 aa  253  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  37.29 
 
 		 449 aa  250  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  36.28 
 
 		 461 aa  250  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  40.35 
 
 		 438 aa  249  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  35.86 
 
 		 440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  37.03 
 
 		 472 aa  232  8.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 465 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 467 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 		 440 aa  230  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 448 aa  229  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 468 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 465 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  37.08 
 
 		 424 aa  229  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 467 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 470 aa  226  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 416 aa  225  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  35.86 
 
 		 424 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  35.55 
 
 		 443 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  35.09 
 
 		 457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  34.84 
 
 		 457 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 442 aa  209  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 443 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  31.76 
 
 		 475 aa  203  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  48.18 
 
 		 578 aa  199  7.999999999999999e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  34.08 
 
 		 426 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 451 aa  194  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 		 413 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 437 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 413 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  49.76 
 
 		 542 aa  186  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 464 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 461 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 454 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 443 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 		 478 aa  171  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 471 aa  170  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  31.81 
 
 		 426 aa  170  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  36.64 
 
 		 456 aa  169  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 		 426 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  35.23 
 
 		 472 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 464 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 426 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  48.11 
 
 		 530 aa  164  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 440 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 461 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  47.31 
 
 		 536 aa  162  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 454 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  34.44 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 490 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 405 aa  156  7e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 416 aa  154  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 454 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 448 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  33.7 
 
 		 471 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 418 aa  150  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 450 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 442 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 461 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 446 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  34.33 
 
 		 479 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 432 aa  146  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 453 aa  146  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  45.81 
 
 		 198 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 457 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 457 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 453 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 426 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 426 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 422 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 447 aa  132  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 443 aa  124  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 850 aa  122  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 442 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 460 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 459 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 440 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 533 aa  119  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 437 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2598  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.200679 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>