More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2598 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2598  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 420 aa  832    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 413 aa  193  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 422 aa  172  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3842  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 420 aa  167  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3254  major facilitator superfamily MFS_1  33.81 
 
 		 416 aa  166  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254674  normal  0.0467898 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2064  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 410 aa  160  5e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000913971  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2623  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 		 422 aa  156  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 850 aa  139  6e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 413 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 413 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 418 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 405 aa  119  7e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 438 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 		 426 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  25.13 
 
 		 426 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 430 aa  106  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 434 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 426 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  29.39 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  27.72 
 
 		 440 aa  100  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 423 aa  100  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  24.17 
 
 		 457 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 443 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  24.17 
 
 		 457 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 443 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 470 aa  96.3  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  26.3 
 
 		 452 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  25.24 
 
 		 432 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  25.24 
 
 		 432 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  25.24 
 
 		 432 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 453 aa  94.7  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  26.3 
 
 		 452 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  26.3 
 
 		 452 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 405 aa  94.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  26.3 
 
 		 452 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  26.3 
 
 		 452 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  26.05 
 
 		 451 aa  94  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5920  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 435 aa  94  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0977977  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 465 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 467 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  27.27 
 
 		 438 aa  93.2  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 446 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  28.67 
 
 		 446 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 468 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  28.53 
 
 		 450 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  25.31 
 
 		 450 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  25.31 
 
 		 450 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  25.31 
 
 		 450 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  25.31 
 
 		 450 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  25.31 
 
 		 440 aa  91.3  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  27.42 
 
 		 453 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  25.31 
 
 		 450 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  25.31 
 
 		 450 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  25.31 
 
 		 450 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 467 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 440 aa  90.1  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 433 aa  89.7  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  25.31 
 
 		 450 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 441 aa  89.7  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 465 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 452 aa  89.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6596  d-galactonate transporter  25.47 
 
 		 457 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  27.61 
 
 		 450 aa  89  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  27.27 
 
 		 428 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  27.12 
 
 		 449 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  27.27 
 
 		 428 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  27.92 
 
 		 428 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  24.75 
 
 		 475 aa  87.8  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 418 aa  88.2  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  27.27 
 
 		 428 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  27.27 
 
 		 428 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  22.62 
 
 		 443 aa  87  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2612  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 433 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209857  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.65 
 
 		 433 aa  86.7  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 436 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 436 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21441  predicted protein  25.94 
 
 		 416 aa  86.3  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389719  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 436 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  27.24 
 
 		 448 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  24.09 
 
 		 427 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  24.52 
 
 		 436 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 436 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 448 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.03 
 
 		 437 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  25.86 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  25.86 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  25.86 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  26.33 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  26.33 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>