More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2064 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2064  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 410 aa  824    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000913971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3254  major facilitator superfamily MFS_1  64.44 
 
 		 416 aa  513  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254674  normal  0.0467898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2623  major facilitator superfamily MFS_1  62.22 
 
 		 422 aa  509  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3842  major facilitator transporter  55.91 
 
 		 420 aa  452  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 		 422 aa  272  9e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 413 aa  260  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  35.05 
 
 		 850 aa  224  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2598  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 420 aa  152  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 438 aa  109  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 405 aa  106  8e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 426 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 426 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 405 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  25.83 
 
 		 426 aa  99.8  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 450 aa  96.3  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3962  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 420 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0137  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 427 aa  94.4  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711872  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 578 aa  94  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 440 aa  92.8  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 451 aa  92  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 426 aa  92  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  27.12 
 
 		 457 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  27.12 
 
 		 457 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 433 aa  91.3  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 		 415 aa  90.1  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 464 aa  89.4  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 435 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 443 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 469 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  25 
 
 		 453 aa  89  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 465 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 463 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 468 aa  87  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 438 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 434 aa  87  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 465 aa  87  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  24.67 
 
 		 427 aa  87  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 506 aa  86.7  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 442 aa  86.7  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 427 aa  86.3  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 427 aa  86.3  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 463 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 479 aa  86.3  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 463 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 443 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 472 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 542 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 467 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 444 aa  84  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  24.22 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 467 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  23.09 
 
 		 454 aa  83.2  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 470 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  27.01 
 
 		 440 aa  82.8  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  22.62 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  23.95 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 478 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 		 453 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  22.51 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7255  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 448 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 440 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  24.29 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  24.43 
 
 		 453 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  28.63 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  22.11 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  23.33 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  23.19 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 472 aa  78.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  22.74 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4207  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0961062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4159  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  decreased coverage  0.00263409 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  23.92 
 
 		 475 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  25 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 461 aa  76.3  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>