More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2211 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 413 aa  818    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  53.23 
 
 		 422 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  49.75 
 
 		 405 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  43.95 
 
 		 850 aa  320  1.9999999999999998e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3842  major facilitator transporter  40.86 
 
 		 420 aa  289  7e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2064  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 410 aa  283  3.0000000000000004e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000913971  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2623  major facilitator superfamily MFS_1  40.78 
 
 		 422 aa  283  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3254  major facilitator superfamily MFS_1  42.46 
 
 		 416 aa  280  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254674  normal  0.0467898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2598  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 		 420 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 441 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 438 aa  126  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 427 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 413 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 427 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 405 aa  122  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 441 aa  121  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 413 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 444 aa  120  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 430 aa  120  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  31.8 
 
 		 405 aa  119  7.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  27.63 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  25.13 
 
 		 448 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 443 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 446 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.63 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 450 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 442 aa  112  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 426 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5920  major facilitator transporter  30.04 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0977977  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  29.19 
 
 		 441 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 442 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 428 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 435 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 418 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 440 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 440 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 434 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 432 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  29.19 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  29.19 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  29.19 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  27.83 
 
 		 426 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 426 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  29.19 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  27.24 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  29.19 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  29.09 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  27.98 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2612  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 433 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209857  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 441 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 427 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 439 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 432 aa  107  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 440 aa  106  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 416 aa  106  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3710  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 408 aa  106  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.010262 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 428 aa  106  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  23.7 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  28.04 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 452 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  28.62 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  29.68 
 
 		 398 aa  104  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 409 aa  104  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 440 aa  104  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  27.83 
 
 		 433 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 451 aa  104  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  28.84 
 
 		 424 aa  103  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 542 aa  103  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 578 aa  102  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 439 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0299  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 442 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  27.85 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2645  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2535  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2587  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 432 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  26.84 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 439 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 439 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>