More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4843 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  93.67 
 
 
442 aa  763    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  100 
 
 
442 aa  861    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  93.21 
 
 
442 aa  785    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  64.77 
 
 
441 aa  552  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  65.99 
 
 
441 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  63.57 
 
 
441 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  63.34 
 
 
441 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  63.34 
 
 
441 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  63.34 
 
 
441 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  63.34 
 
 
441 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  63.34 
 
 
441 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  61.26 
 
 
440 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  57.67 
 
 
443 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  57.61 
 
 
426 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  57.85 
 
 
426 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  39.72 
 
 
452 aa  245  9e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  36.3 
 
 
447 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  34.74 
 
 
434 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  29.41 
 
 
405 aa  141  3e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 
413 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 
413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  31.52 
 
 
413 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  30.67 
 
 
416 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  29.58 
 
 
444 aa  124  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  29.67 
 
 
433 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  27.54 
 
 
453 aa  120  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 
426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  29.67 
 
 
426 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  29.26 
 
 
418 aa  116  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  25.18 
 
 
461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  29.16 
 
 
428 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 
426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  27.63 
 
 
468 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  27.15 
 
 
440 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  27.21 
 
 
443 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  29.26 
 
 
432 aa  107  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  26.54 
 
 
465 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  27.14 
 
 
465 aa  106  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  28.24 
 
 
448 aa  106  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  26.89 
 
 
467 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  26.89 
 
 
467 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  28.26 
 
 
438 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  27.76 
 
 
438 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  28.13 
 
 
440 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  28.13 
 
 
440 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  26.67 
 
 
405 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  26.96 
 
 
470 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  29.29 
 
 
426 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  27.62 
 
 
438 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  26.89 
 
 
475 aa  98.6  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  26.34 
 
 
435 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  30.13 
 
 
418 aa  97.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 
427 aa  97.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 
427 aa  97.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  26.6 
 
 
432 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  26.92 
 
 
423 aa  96.3  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  27.68 
 
 
441 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 
413 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  26.95 
 
 
506 aa  94.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  26.86 
 
 
433 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  26.6 
 
 
432 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  25.4 
 
 
433 aa  93.6  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 
453 aa  93.6  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  26.6 
 
 
432 aa  93.6  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  26.6 
 
 
433 aa  93.2  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  26.33 
 
 
433 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  25.86 
 
 
440 aa  93.2  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  26.33 
 
 
432 aa  92.8  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  26.6 
 
 
432 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5549  major facilitator transporter  25.92 
 
 
450 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408354  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 
422 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  27.49 
 
 
454 aa  90.9  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  24.71 
 
 
432 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  25.57 
 
 
448 aa  89.7  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  27.1 
 
 
431 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  23.52 
 
 
437 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 
405 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  27.09 
 
 
453 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  24.33 
 
 
425 aa  87.4  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 
435 aa  87  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  26.29 
 
 
433 aa  86.3  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  24.07 
 
 
472 aa  86.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  29.38 
 
 
430 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  28.57 
 
 
430 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  28.57 
 
 
430 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 
433 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  28.38 
 
 
457 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  27.63 
 
 
439 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5381  transporter, MFS superfamily  26.6 
 
 
432 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269188  normal  0.117501 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  24.84 
 
 
428 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  24.84 
 
 
428 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  24.84 
 
 
428 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  29.41 
 
 
430 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  27.44 
 
 
439 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  27.44 
 
 
439 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  24.93 
 
 
450 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 
471 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  29.13 
 
 
430 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  24.07 
 
 
426 aa  82.8  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  28.47 
 
 
449 aa  82.4  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>