More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1729 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  100 
 
 		 453 aa  899    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  56.75 
 
 		 444 aa  468  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  46.28 
 
 		 430 aa  338  8e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  40.82 
 
 		 438 aa  308  9e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  40.69 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  40.27 
 
 		 506 aa  275  8e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  39.91 
 
 		 440 aa  266  7e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 441 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  39.55 
 
 		 405 aa  253  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  39.25 
 
 		 449 aa  244  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  37.93 
 
 		 438 aa  239  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  34.24 
 
 		 461 aa  236  7e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  36.26 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  35.8 
 
 		 440 aa  232  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  40.65 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 448 aa  224  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 440 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 426 aa  223  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  35.95 
 
 		 438 aa  220  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 443 aa  217  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  34.61 
 
 		 468 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  35.64 
 
 		 457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 467 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 465 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  35.4 
 
 		 457 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 465 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 470 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 467 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  35.43 
 
 		 424 aa  209  9e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  35.24 
 
 		 442 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 424 aa  203  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  34.21 
 
 		 475 aa  199  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 454 aa  196  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 433 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  48.87 
 
 		 578 aa  188  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 437 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 451 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 471 aa  176  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 461 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 435 aa  173  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  47.22 
 
 		 542 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  34 
 
 		 456 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  30.44 
 
 		 478 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 530 aa  164  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  31.14 
 
 		 413 aa  163  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 443 aa  162  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 536 aa  162  9e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 464 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 453 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  30.84 
 
 		 413 aa  158  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  34.7 
 
 		 413 aa  156  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 461 aa  156  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  30 
 
 		 457 aa  156  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 441 aa  156  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 		 434 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 432 aa  153  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 451 aa  149  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 464 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  30.58 
 
 		 426 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 448 aa  146  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 442 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  31.51 
 
 		 471 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 461 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 426 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  33.7 
 
 		 479 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  31.44 
 
 		 449 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 405 aa  140  6e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 472 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 450 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  45.39 
 
 		 198 aa  136  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 490 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 441 aa  133  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  28.61 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  28.61 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 447 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  28.61 
 
 		 441 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  28.61 
 
 		 441 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  28.61 
 
 		 441 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  28.61 
 
 		 441 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 423 aa  127  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 426 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 446 aa  126  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 533 aa  126  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 452 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 426 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 454 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 440 aa  120  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>