More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0227 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  100 
 
 		 438 aa  852    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  54.76 
 
 		 405 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  52.64 
 
 		 418 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  40.99 
 
 		 433 aa  283  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  38.75 
 
 		 440 aa  269  8.999999999999999e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 444 aa  269  8.999999999999999e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  39.01 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  38.06 
 
 		 441 aa  262  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  38.43 
 
 		 448 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  37.08 
 
 		 438 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  37.93 
 
 		 453 aa  257  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 442 aa  245  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  60 
 
 		 578 aa  242  7.999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  37.84 
 
 		 449 aa  242  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  37.23 
 
 		 506 aa  225  9e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 470 aa  216  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 465 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 467 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 465 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 467 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 468 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  35.15 
 
 		 475 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 424 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  35.84 
 
 		 424 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 461 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 461 aa  187  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  31.64 
 
 		 443 aa  186  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 426 aa  186  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 472 aa  182  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 433 aa  180  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  31.3 
 
 		 457 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 440 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 454 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 437 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  30.87 
 
 		 457 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  38.56 
 
 		 456 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  36.91 
 
 		 432 aa  170  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 451 aa  169  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  33.65 
 
 		 478 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  32.33 
 
 		 435 aa  169  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 451 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 471 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 405 aa  159  7e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 454 aa  156  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  31.57 
 
 		 413 aa  156  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 441 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 413 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 450 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 426 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 443 aa  146  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  42.31 
 
 		 542 aa  145  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 426 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 418 aa  143  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 530 aa  142  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  43.62 
 
 		 536 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 464 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 461 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 426 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  32.24 
 
 		 426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  46.75 
 
 		 198 aa  136  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 464 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 472 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 432 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  30.84 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  31.87 
 
 		 441 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  31.7 
 
 		 479 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  31.87 
 
 		 441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  31.87 
 
 		 441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  31.87 
 
 		 441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  31.87 
 
 		 441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 453 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  31.63 
 
 		 441 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  31.41 
 
 		 471 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 441 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 460 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 443 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 452 aa  126  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 461 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 490 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 442 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 442 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 423 aa  123  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>