More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4301 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  100 
 
 		 461 aa  909    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  41.99 
 
 		 472 aa  319  7e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  41.47 
 
 		 468 aa  312  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  40.78 
 
 		 465 aa  309  8e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 470 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  40.78 
 
 		 467 aa  306  7e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  40.32 
 
 		 467 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  41.97 
 
 		 454 aa  302  7.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  40.55 
 
 		 465 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  41.53 
 
 		 433 aa  299  6e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  39.41 
 
 		 475 aa  293  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  40.63 
 
 		 440 aa  285  9e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  37.79 
 
 		 443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  37.95 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  37.73 
 
 		 457 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  40 
 
 		 437 aa  262  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  36.9 
 
 		 456 aa  249  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  39.36 
 
 		 478 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  34 
 
 		 457 aa  237  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  37.38 
 
 		 443 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  35.63 
 
 		 472 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 451 aa  216  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  35.4 
 
 		 450 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  36.26 
 
 		 440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 490 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  45.7 
 
 		 542 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  35.24 
 
 		 405 aa  180  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 		 471 aa  179  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 457 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 438 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 453 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 444 aa  167  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 454 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 461 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  41.08 
 
 		 536 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  32.25 
 
 		 441 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 453 aa  163  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 438 aa  162  8.000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  43.64 
 
 		 530 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  33.44 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  33.91 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 446 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  32.44 
 
 		 430 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 449 aa  157  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 450 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 461 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 433 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 578 aa  150  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 433 aa  150  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 506 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0795  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 484 aa  147  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 459 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 418 aa  146  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1677  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0505  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 449 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 460 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 448 aa  137  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 453 aa  134  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 447 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 413 aa  131  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 413 aa  130  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 427 aa  124  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 427 aa  124  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 		 447 aa  123  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  29.4 
 
 		 424 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 461 aa  121  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  31.01 
 
 		 426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 442 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 432 aa  118  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  31.83 
 
 		 479 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 426 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 413 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  40.65 
 
 		 198 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 438 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 424 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 442 aa  114  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  30.53 
 
 		 471 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  30.58 
 
 		 449 aa  108  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 533 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2369  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 447 aa  107  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 423 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 415 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 416 aa  100  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0585  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 449 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.0455182 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 434 aa  97.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  25.47 
 
 		 453 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  25.79 
 
 		 436 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 453 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>