More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1677 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1677  major facilitator transporter  100 
 
 		 444 aa  855    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  42.32 
 
 		 450 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 433 aa  202  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 454 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 472 aa  188  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 468 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 465 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 467 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 467 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 470 aa  183  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  30.55 
 
 		 465 aa  183  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 443 aa  179  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  31.14 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  30.9 
 
 		 457 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 451 aa  178  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  31.93 
 
 		 475 aa  177  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 450 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 461 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 457 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 454 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 478 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 456 aa  156  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 440 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 444 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 441 aa  143  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  31 
 
 		 472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 440 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 490 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 457 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 438 aa  123  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 461 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 448 aa  121  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 443 aa  121  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 454 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 453 aa  119  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 542 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  26.24 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 446 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 440 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 438 aa  111  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  25 
 
 		 441 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 459 aa  109  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 447 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  34.08 
 
 		 449 aa  107  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 426 aa  107  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 433 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 461 aa  104  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 536 aa  103  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 448 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 506 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 418 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 453 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 460 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 426 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  28.8 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  30.82 
 
 		 426 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 433 aa  97.1  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  23.64 
 
 		 430 aa  94.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 423 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 471 aa  94  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 530 aa  93.6  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2369  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 447 aa  92.8  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  33.86 
 
 		 578 aa  92.4  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 442 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 450 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0505  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 449 aa  91.3  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  26.21 
 
 		 424 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  27.84 
 
 		 449 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  27.98 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  26.71 
 
 		 449 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  23.54 
 
 		 461 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  33.1 
 
 		 198 aa  82  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  28.32 
 
 		 479 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  28.83 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  24.6 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0585  major facilitator superfamily MFS_1  30.82 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.0455182 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  25.45 
 
 		 436 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 533 aa  80.5  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  33.83 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 405 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3235  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8658  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>