More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0800 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  100 
 
 		 533 aa  1046    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  36.99 
 
 		 542 aa  273  4.0000000000000004e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 530 aa  260  3e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  34.82 
 
 		 536 aa  249  9e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  40.5 
 
 		 472 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  37.34 
 
 		 426 aa  139  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 443 aa  138  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  40.38 
 
 		 457 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  37.31 
 
 		 456 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  40.38 
 
 		 457 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 449 aa  135  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 453 aa  134  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 433 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 578 aa  134  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 437 aa  133  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  36.27 
 
 		 444 aa  133  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 433 aa  133  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  38.35 
 
 		 441 aa  133  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 		 440 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  35.86 
 
 		 468 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  34.16 
 
 		 475 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 467 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  37.07 
 
 		 506 aa  127  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  40.7 
 
 		 450 aa  127  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  35.21 
 
 		 441 aa  124  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  39.67 
 
 		 438 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 461 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  35.82 
 
 		 440 aa  121  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  36.55 
 
 		 449 aa  120  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 440 aa  117  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  38.38 
 
 		 443 aa  117  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 430 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  39.13 
 
 		 440 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 451 aa  114  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 450 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  35.55 
 
 		 438 aa  113  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  34.45 
 
 		 479 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  34.03 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 461 aa  110  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  36.76 
 
 		 472 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 448 aa  110  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  34.06 
 
 		 442 aa  109  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 464 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 405 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  38.3 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  37.97 
 
 		 198 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 461 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  36.95 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  33.62 
 
 		 438 aa  105  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 442 aa  104  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  35.16 
 
 		 471 aa  104  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  33.19 
 
 		 464 aa  103  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 457 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 413 aa  99.4  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 418 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  34.91 
 
 		 490 aa  98.2  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 418 aa  98.2  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  40.32 
 
 		 432 aa  97.8  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 442 aa  97.8  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 459 aa  96.3  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 453 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  34.85 
 
 		 426 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  36.59 
 
 		 416 aa  94.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 457 aa  94  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  34.34 
 
 		 426 aa  94  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 		 426 aa  93.6  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 423 aa  93.2  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 416 aa  93.2  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 453 aa  90.9  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  38.33 
 
 		 448 aa  90.5  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 		 427 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  34.16 
 
 		 439 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 		 427 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 439 aa  88.6  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 434 aa  87.4  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  32.64 
 
 		 436 aa  86.7  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  34.6 
 
 		 460 aa  86.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 439 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 439 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 461 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 431 aa  84.7  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  40.15 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  34.52 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  35.16 
 
 		 448 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 440 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>