More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4352 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  100 
 
 
453 aa  877    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0685  major facilitator transporter  37.8 
 
 
438 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2369  major facilitator transporter  32.78 
 
 
447 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  30.79 
 
 
443 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  32.45 
 
 
450 aa  173  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  32.29 
 
 
454 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  30.66 
 
 
433 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 
478 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  28.81 
 
 
472 aa  161  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  31.42 
 
 
437 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  30.39 
 
 
470 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  29.74 
 
 
467 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  28.37 
 
 
475 aa  159  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  29.43 
 
 
465 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  29.18 
 
 
465 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  29.26 
 
 
467 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  35.6 
 
 
441 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  30.79 
 
 
457 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  30.79 
 
 
457 aa  156  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  30.1 
 
 
468 aa  156  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  30.09 
 
 
456 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  29.68 
 
 
461 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  27.65 
 
 
454 aa  150  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  30 
 
 
451 aa  149  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  29.95 
 
 
472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  31.58 
 
 
426 aa  146  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  32.01 
 
 
438 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  32.1 
 
 
405 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 
440 aa  143  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  28.67 
 
 
490 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  33.01 
 
 
440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 
471 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  31.7 
 
 
443 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  32.88 
 
 
444 aa  138  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  29.11 
 
 
464 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  29.36 
 
 
464 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  34.56 
 
 
461 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  31.9 
 
 
433 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  31.96 
 
 
457 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  33.11 
 
 
438 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  30.8 
 
 
461 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  36.65 
 
 
542 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  32.47 
 
 
430 aa  128  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  28.9 
 
 
453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  28.03 
 
 
453 aa  126  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  31.96 
 
 
449 aa  126  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  29 
 
 
461 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  27.83 
 
 
459 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  30.28 
 
 
440 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  35.92 
 
 
578 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  29.89 
 
 
433 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  27.88 
 
 
443 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  30.72 
 
 
446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  34.94 
 
 
447 aa  121  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  37.13 
 
 
448 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  35.26 
 
 
447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  28.74 
 
 
441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  26.58 
 
 
454 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  33.59 
 
 
440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  36.24 
 
 
530 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  28.89 
 
 
460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  28.38 
 
 
457 aa  110  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  30.31 
 
 
438 aa  109  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  26.35 
 
 
506 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  29.49 
 
 
450 aa  108  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  35.44 
 
 
536 aa  107  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  32.17 
 
 
448 aa  106  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  27.43 
 
 
424 aa  106  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  34.09 
 
 
418 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  29.34 
 
 
442 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  34.72 
 
 
198 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  35.05 
 
 
416 aa  100  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  27 
 
 
424 aa  99.8  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 
413 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  29.64 
 
 
479 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  29.43 
 
 
442 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  30.5 
 
 
450 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  29.96 
 
 
471 aa  96.7  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1677  major facilitator transporter  30.2 
 
 
444 aa  96.3  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  28.92 
 
 
405 aa  95.1  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  29.21 
 
 
426 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 
413 aa  93.6  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 
413 aa  93.2  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  37.5 
 
 
442 aa  92.8  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  30.81 
 
 
451 aa  92.8  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  26.17 
 
 
418 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 
426 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  28.78 
 
 
449 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  33.33 
 
 
533 aa  90.5  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  32.9 
 
 
452 aa  90.1  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  27.37 
 
 
413 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 
434 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  27.62 
 
 
426 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 
426 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0505  major facilitator transporter  26.46 
 
 
449 aa  87.8  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  27.62 
 
 
426 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  27.96 
 
 
423 aa  87  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  26.18 
 
 
416 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0585  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 
449 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.0455182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  25.93 
 
 
452 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>