More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0383 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  100 
 
 		 457 aa  899    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 468 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  33.65 
 
 		 465 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  33.99 
 
 		 457 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 467 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  33.74 
 
 		 457 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 465 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 467 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  33.89 
 
 		 470 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  32.61 
 
 		 475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  33.86 
 
 		 433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 457 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  33.64 
 
 		 440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 461 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 437 aa  196  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 454 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 472 aa  193  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 443 aa  186  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 450 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 451 aa  180  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  32 
 
 		 441 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 456 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 		 478 aa  171  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 464 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 461 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 490 aa  167  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 443 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 433 aa  163  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 453 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 440 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 464 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 454 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  30.53 
 
 		 440 aa  153  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 454 aa  149  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 472 aa  149  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 441 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 542 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 461 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 		 426 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 447 aa  137  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 459 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  29.78 
 
 		 426 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 430 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 434 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 438 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 405 aa  129  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 426 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 536 aa  126  9e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 447 aa  124  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0585  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.0455182 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 450 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 435 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 447 aa  121  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 452 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 443 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 453 aa  120  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 448 aa  119  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 530 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1677  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  24.95 
 
 		 461 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 442 aa  114  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 416 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 427 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 427 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 405 aa  111  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 440 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 413 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 413 aa  108  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 438 aa  107  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0505  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 449 aa  106  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2369  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 447 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  25.76 
 
 		 436 aa  103  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 443 aa  103  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  26.04 
 
 		 424 aa  103  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 424 aa  103  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 533 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 442 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  28 
 
 		 439 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  28 
 
 		 439 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 418 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  28 
 
 		 439 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 439 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  27.74 
 
 		 441 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  27.74 
 
 		 441 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  27.74 
 
 		 441 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  27.74 
 
 		 441 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>