More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4600 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  100 
 
 		 442 aa  869    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  75 
 
 		 438 aa  591  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  58.9 
 
 		 448 aa  471  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  43.26 
 
 		 433 aa  280  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 438 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 438 aa  230  4e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  35.24 
 
 		 453 aa  230  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 405 aa  229  7e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  34.64 
 
 		 506 aa  227  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 441 aa  220  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  39 
 
 		 418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  34.24 
 
 		 440 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 430 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 472 aa  186  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 468 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 461 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 465 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 443 aa  180  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 467 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 467 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 470 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  43.72 
 
 		 578 aa  176  6e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  33 
 
 		 475 aa  176  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 		 440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 426 aa  172  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 433 aa  170  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 440 aa  169  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  33.51 
 
 		 457 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  33.51 
 
 		 457 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 443 aa  159  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 443 aa  153  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 437 aa  153  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  30.02 
 
 		 424 aa  147  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 424 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 456 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 542 aa  140  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 		 426 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  32.47 
 
 		 426 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 		 426 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 450 aa  136  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 478 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 413 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  38.39 
 
 		 536 aa  134  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 434 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 448 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  37.61 
 
 		 530 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 461 aa  126  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 490 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 418 aa  123  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 451 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  32.24 
 
 		 479 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 		 413 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 464 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 457 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 471 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  40.25 
 
 		 198 aa  120  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  32.27 
 
 		 449 aa  120  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 450 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  32.13 
 
 		 471 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 439 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 459 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 439 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  26.51 
 
 		 448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 446 aa  111  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 454 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3034  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 432 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.201695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 472 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3842  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 420 aa  107  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 441 aa  106  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>