More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0710 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  100 
 
 
454 aa  882    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  42.89 
 
 
433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  40.59 
 
 
472 aa  308  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  41.97 
 
 
461 aa  302  7.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  41.55 
 
 
440 aa  294  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  39.01 
 
 
457 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  38.77 
 
 
457 aa  276  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  36.96 
 
 
465 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  36.73 
 
 
468 aa  267  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  37.16 
 
 
465 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  36.84 
 
 
467 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  36.61 
 
 
467 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  36.1 
 
 
470 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  37.2 
 
 
475 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  37.41 
 
 
443 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  37 
 
 
451 aa  249  9e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  38 
 
 
456 aa  246  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 
478 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  39.91 
 
 
437 aa  229  9e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  37.24 
 
 
464 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  36.01 
 
 
464 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  36.56 
 
 
443 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  36.3 
 
 
441 aa  219  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  36.75 
 
 
450 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  33.25 
 
 
457 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  33.33 
 
 
490 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  33.26 
 
 
454 aa  201  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  32.06 
 
 
444 aa  200  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  33.85 
 
 
453 aa  196  7e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  34.65 
 
 
440 aa  189  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  34.72 
 
 
472 aa  189  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  32.17 
 
 
461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  33.25 
 
 
440 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  34.82 
 
 
446 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  34.41 
 
 
454 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  33.25 
 
 
405 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  31.81 
 
 
453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  32.85 
 
 
448 aa  173  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  32.36 
 
 
457 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  44.59 
 
 
542 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  34.38 
 
 
461 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  33.18 
 
 
426 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  31.55 
 
 
440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  31.78 
 
 
433 aa  167  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  30.75 
 
 
438 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  34.47 
 
 
447 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  31.86 
 
 
430 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 
447 aa  163  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  32.24 
 
 
438 aa  162  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  30.98 
 
 
450 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 
471 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  32.29 
 
 
453 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  43.56 
 
 
530 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  27.95 
 
 
459 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  28.86 
 
 
443 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  33.58 
 
 
418 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  31.09 
 
 
448 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  32.58 
 
 
460 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  31.39 
 
 
438 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  30.51 
 
 
441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  30.26 
 
 
449 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  42.61 
 
 
536 aa  143  8e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  30.27 
 
 
433 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  32.82 
 
 
442 aa  141  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  29.6 
 
 
506 aa  137  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1677  major facilitator transporter  30.37 
 
 
444 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  30.21 
 
 
426 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 
426 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  38.18 
 
 
578 aa  132  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  26.29 
 
 
461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  36.8 
 
 
533 aa  126  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  29.7 
 
 
413 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0585  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 
449 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.0455182 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  27.06 
 
 
442 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  31.14 
 
 
442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  26.15 
 
 
423 aa  117  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0505  major facilitator transporter  31.55 
 
 
449 aa  117  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2369  major facilitator transporter  29.63 
 
 
447 aa  116  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 
413 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  30.34 
 
 
416 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 
413 aa  114  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  28.12 
 
 
416 aa  112  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  32.24 
 
 
432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0795  major facilitator transporter  28.86 
 
 
484 aa  112  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  30.82 
 
 
450 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  31.01 
 
 
479 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  39.13 
 
 
198 aa  110  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  29.72 
 
 
432 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  25.67 
 
 
426 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  30.05 
 
 
452 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  30.45 
 
 
471 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  27.14 
 
 
428 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  29.26 
 
 
449 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  25.54 
 
 
426 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  28.54 
 
 
440 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  28.54 
 
 
440 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 
435 aa  103  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.20349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>