More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A2335 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  100 
 
 
441 aa  852    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  100 
 
 
441 aa  852    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  99.55 
 
 
441 aa  848    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  99.77 
 
 
441 aa  850    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  100 
 
 
441 aa  852    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  100 
 
 
441 aa  852    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  69.28 
 
 
441 aa  587  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  63.24 
 
 
441 aa  522  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  63.81 
 
 
442 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  63.34 
 
 
442 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  64.27 
 
 
442 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  59.86 
 
 
440 aa  471  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  57.98 
 
 
443 aa  474  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  58.29 
 
 
426 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  58.47 
 
 
426 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  39.33 
 
 
452 aa  262  6.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  37.09 
 
 
447 aa  245  9e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 
434 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 
413 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 
413 aa  141  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  27.95 
 
 
405 aa  134  3.9999999999999996e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  31.5 
 
 
416 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  30.87 
 
 
444 aa  130  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  28.61 
 
 
453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  30.5 
 
 
433 aa  124  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  31.17 
 
 
413 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  29.3 
 
 
443 aa  120  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  30.71 
 
 
405 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 
426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  31 
 
 
438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  30.91 
 
 
426 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  30.94 
 
 
426 aa  117  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 
426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  28.51 
 
 
461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  32.28 
 
 
448 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  27.6 
 
 
438 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  29.81 
 
 
438 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  31.93 
 
 
418 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 
413 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  27.42 
 
 
418 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  30.68 
 
 
433 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  24.56 
 
 
468 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  27.96 
 
 
440 aa  97.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  25.91 
 
 
470 aa  97.1  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  25.38 
 
 
467 aa  97.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  25.38 
 
 
465 aa  97.1  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  25.63 
 
 
467 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  28.91 
 
 
441 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  25.38 
 
 
465 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  28.64 
 
 
437 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 
435 aa  94  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  26.57 
 
 
454 aa  94  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 
471 aa  94  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  27.11 
 
 
440 aa  93.6  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  25.42 
 
 
437 aa  93.2  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  26.34 
 
 
428 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  30.13 
 
 
432 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  27.53 
 
 
440 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  27.53 
 
 
440 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  27.27 
 
 
423 aa  91.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  24.19 
 
 
475 aa  91.3  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  26.28 
 
 
431 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  27.32 
 
 
432 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 
453 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  25.67 
 
 
433 aa  87.4  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  27.25 
 
 
457 aa  87.8  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  25.39 
 
 
440 aa  87.4  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  25.67 
 
 
433 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  25.67 
 
 
432 aa  87  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  25.67 
 
 
432 aa  87  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  28.61 
 
 
442 aa  87  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  25.94 
 
 
432 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  25.67 
 
 
432 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  25.4 
 
 
432 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  25.4 
 
 
433 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  27.59 
 
 
449 aa  85.5  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  25.4 
 
 
433 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 
405 aa  84.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  26.42 
 
 
430 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  26.67 
 
 
425 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  26.47 
 
 
506 aa  83.2  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
427 aa  83.2  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
427 aa  83.2  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  26.48 
 
 
435 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  24.2 
 
 
451 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
430 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 
478 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  36.92 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  23.88 
 
 
426 aa  79.7  0.00000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5381  transporter, MFS superfamily  26.74 
 
 
432 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269188  normal  0.117501 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  24.71 
 
 
472 aa  79.7  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  24.07 
 
 
441 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 
431 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  27.96 
 
 
461 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  27.54 
 
 
454 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  27.78 
 
 
416 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  33.17 
 
 
459 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  28.09 
 
 
443 aa  78.2  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  27.79 
 
 
457 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3254  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 
416 aa  77  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254674  normal  0.0467898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>