More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4141 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  100 
 
 		 442 aa  856    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  39.18 
 
 		 471 aa  259  9e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  37.1 
 
 		 461 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 453 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  32.16 
 
 		 472 aa  190  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 454 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  33.83 
 
 		 437 aa  186  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  34.91 
 
 		 446 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 468 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 465 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 467 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 467 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 464 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 470 aa  173  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 459 aa  170  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  28.98 
 
 		 475 aa  169  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  32.9 
 
 		 457 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  32.9 
 
 		 457 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 433 aa  163  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 443 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 464 aa  156  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 490 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 440 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 443 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 454 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 461 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 444 aa  150  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 461 aa  150  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 451 aa  149  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 440 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 461 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 542 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 		 478 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 456 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 453 aa  143  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 454 aa  140  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 450 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 418 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 443 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  43.09 
 
 		 536 aa  130  7.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  28.68 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 506 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 453 aa  120  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  38.68 
 
 		 530 aa  117  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 416 aa  117  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 448 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 578 aa  107  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 533 aa  106  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 450 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 448 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  29.09 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 451 aa  100  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 423 aa  96.3  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 438 aa  95.5  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 416 aa  94.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  27.81 
 
 		 449 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 426 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 435 aa  94  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 		 426 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 447 aa  94  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0585  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 449 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.0455182 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  31.2 
 
 		 426 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 434 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 447 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  30.24 
 
 		 460 aa  87.8  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 433 aa  87.8  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  29.39 
 
 		 471 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 432 aa  82.4  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  28.42 
 
 		 479 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 		 453 aa  80.1  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  33.75 
 
 		 198 aa  79.7  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 440 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3842  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1677  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2369  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 447 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  24.7 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>