More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7588 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  100 
 
 
490 aa  988    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  56.48 
 
 
464 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  57.88 
 
 
464 aa  475  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  34.64 
 
 
472 aa  259  5.0000000000000005e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  35.62 
 
 
467 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  35.16 
 
 
468 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  35.16 
 
 
465 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  35.39 
 
 
467 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  34.87 
 
 
470 aa  257  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  35.32 
 
 
465 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  36.56 
 
 
440 aa  247  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  37.96 
 
 
433 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  34.1 
 
 
475 aa  243  7e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  36.22 
 
 
443 aa  242  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  37.53 
 
 
437 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  36.44 
 
 
457 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  36.44 
 
 
457 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  33.33 
 
 
454 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  34.93 
 
 
451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  32.4 
 
 
457 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  33.88 
 
 
441 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  31.22 
 
 
461 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  33.19 
 
 
478 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  33.74 
 
 
443 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  32.52 
 
 
461 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  32.51 
 
 
456 aa  187  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  30.3 
 
 
454 aa  187  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  33.33 
 
 
472 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  33.49 
 
 
450 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  33.09 
 
 
446 aa  176  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  30.87 
 
 
454 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  33.52 
 
 
426 aa  170  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  31.59 
 
 
440 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  29.81 
 
 
459 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  31.5 
 
 
440 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  30.79 
 
 
453 aa  156  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  30.6 
 
 
457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 
471 aa  154  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  30.11 
 
 
448 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  31.59 
 
 
461 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  29.14 
 
 
443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  32.05 
 
 
447 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  30.3 
 
 
430 aa  143  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  29.32 
 
 
405 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  28.35 
 
 
444 aa  136  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  28.12 
 
 
453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 
447 aa  134  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0505  major facilitator transporter  30.05 
 
 
449 aa  133  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  29.28 
 
 
450 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  31.35 
 
 
433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 
413 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 
413 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  30.33 
 
 
413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  28.67 
 
 
453 aa  126  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  28.85 
 
 
438 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  28.37 
 
 
449 aa  124  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  30.16 
 
 
438 aa  124  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2369  major facilitator transporter  27.6 
 
 
447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0795  major facilitator transporter  27.04 
 
 
484 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  28.92 
 
 
448 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  29.59 
 
 
418 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  25 
 
 
461 aa  118  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  30.34 
 
 
433 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  38.16 
 
 
536 aa  116  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0585  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 
449 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.0455182 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  25.28 
 
 
442 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  31.31 
 
 
506 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  30.41 
 
 
416 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  25.71 
 
 
441 aa  115  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  26.59 
 
 
418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  35.44 
 
 
542 aa  113  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  27.62 
 
 
460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 
426 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 
434 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  28.64 
 
 
426 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  29.31 
 
 
442 aa  108  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 
426 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  31.17 
 
 
578 aa  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  27.8 
 
 
438 aa  107  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  26.16 
 
 
440 aa  106  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  36.71 
 
 
530 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0685  major facilitator transporter  32.83 
 
 
438 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  25.5 
 
 
451 aa  98.2  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  28.17 
 
 
442 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  28.75 
 
 
416 aa  94.4  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  24.28 
 
 
405 aa  94  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  26.06 
 
 
424 aa  93.2  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1677  major facilitator transporter  29.67 
 
 
444 aa  92  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  25.11 
 
 
435 aa  91.7  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  28.25 
 
 
452 aa  90.5  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  26.48 
 
 
449 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 
850 aa  88.6  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  24.94 
 
 
443 aa  88.6  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  27.34 
 
 
423 aa  87.8  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  34.3 
 
 
533 aa  87  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  24.89 
 
 
424 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  26.98 
 
 
479 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  28.29 
 
 
450 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  27.73 
 
 
432 aa  86.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  27.24 
 
 
471 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>